msconvert - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

msconvert — മാസ് സ്പെക്ട്രോമെട്രി ഡാറ്റ ഫയൽ ഫോർമാറ്റുകൾ പരിവർത്തനം ചെയ്യുക.

സിനോപ്സിസ്

msconvert [ഓപ്ഷനുകൾ] [ഫിൽമാസ്കുകൾ]

വിവരണം

ഈ മാനുവൽ പേജ് ചുരുക്കത്തിൽ രേഖപ്പെടുത്തുന്നു msconvert ഉള്ളിൽ ഷിപ്പ് ചെയ്ത സോഫ്റ്റ്വെയർ libpwiz-ടൂളുകൾ
പാക്കേജ്. മാസ് സ്പെക്ട്രോമെട്രി ഡാറ്റ ഫയലുകൾ ഒരു ഫോർമാറ്റിൽ നിന്ന് പരിവർത്തനം ചെയ്യാൻ ഈ പ്രോഗ്രാം ഒരാളെ അനുവദിക്കുന്നു
മറ്റൊരാളോട്. ഈ പതിപ്പ് സ്വതന്ത്ര സോഫ്റ്റ്‌വെയർ ഡെബിയൻ പ്ലാറ്റ്‌ഫോമിൽ നിർമ്മിച്ചിരിക്കുന്നതിനാൽ, മാത്രം
സ്വതന്ത്ര സോഫ്‌റ്റ്‌വെയർ ഉൾപ്പെടുന്ന പരിവർത്തനങ്ങൾ നടത്താം [അതായത്, *അല്ല*
മൈക്രോസോഫ്റ്റ് വിൻഡോസ് അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള ഡൈനാമിക് ലിങ്കിംഗ് ലൈബ്രറികൾ (dlls)].

ഓപ്ഷനുകൾ

-വി | --വാക്കുകൾ
വിശദമായ പ്രോസസ്സിംഗ് പുരോഗതി വിവരങ്ങൾ പ്രദർശിപ്പിക്കുക.

--സഹായം ഫിൽട്ടർ ഓപ്‌ഷനുകളെക്കുറിച്ചുള്ള കൂടുതൽ വിശദാംശങ്ങളോടെ ഈ സന്ദേശം കാണിക്കുക.

-f | --ഫയലലിസ്റ്റ് ഫയലിന്റെ പേര്
യുടെ ഉള്ളടക്കങ്ങൾ ഉപയോഗിക്കുന്നു ഫയലിന്റെ പേര് ഫയൽനാമങ്ങൾ പട്ടികപ്പെടുത്തുന്നു.

-o | --പുറം മുതലാളി
ഔട്ട്‌പുട്ട് ഡയറക്‌ടറി ('-' stdout-ന്) ആയി സജ്ജമാക്കുക മുതലാളി. സ്ഥിരസ്ഥിതിയായി, ഔട്ട്പുട്ട്
ഡയറക്ടറി '.' (അതായത്, നിലവിലെ പ്രവർത്തിക്കുന്ന ഡയറക്ടറി).

-സി | --config ഫയലിന്റെ പേര്
കോൺഫിഗറേഷൻ ഫയൽ സജ്ജമാക്കുക ഫയലിന്റെ പേര്.

--ഔട്ട്ഫിൽ ഫയലിന്റെ പേര്
ഔട്ട്പുട്ട് ഫയലിന്റെ പേര് അസാധുവാക്കുക.

-ഇ | --എക്സ്റ്റ് ext
ഔട്ട്പുട്ട് ഫയലുകളുടെ വിപുലീകരണം സജ്ജമാക്കുക ext. mzML അല്ലെങ്കിൽ mzXML അല്ലെങ്കിൽ mgf അല്ലെങ്കിൽ
ടെക്സ്റ്റ്.

--mzML എഴുതുക mzML ഫോർമാറ്റ് (സ്ഥിരസ്ഥിതി).

--mzXML എഴുതുക mzXML ഫോർമാറ്റ്.

--mgf എഴുതുക mgf മാസ്കറ്റ് ജനറിക് ഫോർമാറ്റ്.

--ടെക്‌സ്റ്റ് റൈറ്റ് പ്രോട്ടിയോ വിസാർഡ് ഇന്റേണൽ ടെക്സ്റ്റ് ഫോർമാറ്റ്.

--ms1 എഴുതുക MS1 ഫോർമാറ്റ്.

--cms1 എഴുതുക CMS1 ഫോർമാറ്റ്.

--ms2 എഴുതുക MS2 ഫോർമാറ്റ്.

--cms2 എഴുതുക CMS2 ഫോർമാറ്റ്.

--64 ഡിഫോൾട്ട് ബൈനറി എൻകോഡിംഗ് 64-ബിറ്റ് പ്രിസിഷൻ ആയി സജ്ജമാക്കുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി).

--32 ഡിഫോൾട്ട് ബൈനറി എൻകോഡിംഗ് 32-ബിറ്റ് പ്രിസിഷൻ ആയി സജ്ജമാക്കുക.

--mz64 m/z മൂല്യങ്ങൾ 64-ബിറ്റ് കൃത്യതയിൽ എൻകോഡ് ചെയ്യുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി).

--mz32 m/z മൂല്യങ്ങൾ 32-ബിറ്റ് കൃത്യതയിൽ എൻകോഡ് ചെയ്യുക.

--inten64 തീവ്രത മൂല്യങ്ങൾ 64-ബിറ്റ് കൃത്യതയിൽ എൻകോഡ് ചെയ്യുക.

--inten32 തീവ്രത മൂല്യങ്ങൾ 32-ബിറ്റ് കൃത്യതയിൽ എൻകോഡ് ചെയ്യുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി).

--noindex സൂചിക എഴുതരുത്.

-ഞാൻ | --ബന്ധപ്പെടുന്നതിനുള്ള വിവരം ഫയലിന്റെ പേര്
ഉപയോഗം ഫയലിന്റെ പേര് ബന്ധപ്പെടാനുള്ള വിവരങ്ങൾക്ക്.

-z | --zlib
ബൈനറി ഡാറ്റയ്ക്കായി zlib കംപ്രഷൻ ഉപയോഗിക്കുക.

-ജി | --ജിസിപ്പ്
gzip മുഴുവൻ ഔട്ട്‌പുട്ട് ഫയലും (ഫയൽ നാമത്തിലേക്ക് .gz ചേർക്കുന്നു).

--ഫിൽട്ടർ ആർഗ്
ഒരു സ്പെക്ട്രം ലിസ്റ്റ് ഫിൽട്ടർ ചേർക്കുക.

--merge ഫയൽ-ലെവൽ ലയിപ്പിച്ചുകൊണ്ട് ഒന്നിലധികം ഇൻപുട്ട് ഫയലുകളിൽ നിന്ന് ഒരൊറ്റ ഔട്ട്പുട്ട് ഫയൽ സൃഷ്ടിക്കുക
മെറ്റാഡാറ്റയും സ്പെക്ട്രം ലിസ്റ്റുകളും കൂട്ടിച്ചേർക്കുന്നു.

--simAsSpectra
തിരഞ്ഞെടുത്ത അയോൺ മോണിറ്ററിംഗ് ക്രോമാറ്റോഗ്രാമുകളല്ല, സ്പെക്ട്രയായി എഴുതുക.

--srmAsSpectra
തിരഞ്ഞെടുത്ത പ്രതികരണ നിരീക്ഷണം ക്രോമാറ്റോഗ്രാമുകളല്ല, സ്പെക്ട്രയായി എഴുതുക.

ഉദാഹരണങ്ങൾ

data.RAW-ലേക്ക് data.mzXML-ലേക്ക് പരിവർത്തനം ചെയ്യുക

msconvert ഡാറ്റ.RAW --mzXML

my_output_dir-ൽ ഔട്ട്‌പുട്ട് ഫയൽ ഇടുക

msconvert ഡാറ്റ.RAW -o my_output_dir

എക്സ്ട്രാക്റ്റ് സ്കാൻ സൂചികകൾ 5...10, 20...25

msconvert ഡാറ്റ.RAW --ഫിൽട്ടർ "സൂചിക [5,10] [20,25] "

MS1 സ്കാനുകൾ മാത്രം എക്‌സ്‌ട്രാക്‌റ്റ് ചെയ്യുക

msconvert ഡാറ്റ.RAW --ഫിൽട്ടർ "എംഎസ് ലെവൽ 1"

n>1 എന്നതിനായി MSn സ്കാനുകൾ എക്സ്ട്രാക്റ്റ് ചെയ്യുക

msconvert ഡാറ്റ.RAW --ഫിൽട്ടർ "എംഎസ് ലെവൽ 2-"

ഒരു കോൺഫിഗറേഷൻ ഫയൽ ഉപയോഗിക്കുക

msconvert ഡാറ്റ.RAW -c config.txt

തിരികെ , VALUE-

പരാജയപ്പെട്ട ഫയലുകളുടെ എണ്ണം.

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് ഓൺലൈനായി msconvert ഉപയോഗിക്കുക