pymvpa2-ofmotionqc - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

pymvpa2-ofmotionqc - ഒരു OpenFMRI ഡാറ്റാസെറ്റിനായി BOLD fMRI മോഷൻ QC പ്ലോട്ട്

സിനോപ്സിസ്

pymvpa2 ofmotionqc [--പതിപ്പ്] [-h] --പാത PATH [-t ID] [--എസ്റ്റിമേറ്റ്-ഫ്നെയിം NAME]
[--ബന്ധു അവലംബത്തിന്റെ അവലംബത്തിന്റെ] [--ഒഴിവാക്കുക-subjs ID [ID ...]] [--എസ്റ്റിമേറ്റ്-ഓർഡർ LABEL] [--rad2deg]
[--outlier-minthresh OUTLIER_MINTHRESH] [--outlier-stdthresh OUTLIER_STDTHRESH] [--സേവ്ഫിഗ്
സംരക്ഷിക്കുക]

വിവരണം

ഒരു OpenFMRI ഡാറ്റാസെറ്റിൽ നിന്ന് BOLD fMRI മോഷൻ എസ്റ്റിമേറ്റുകൾക്കായി ഒരു QC പ്ലോട്ട് സൃഷ്ടിക്കുക.

സൃഷ്ടിച്ച ചിത്രത്തിൽ രണ്ട് ഉപപ്ലോട്ടുകൾ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു: ഒന്ന് വിവർത്തനത്തിനും ഒന്ന് റൊട്ടേഷനും.
ഓരോ ചലന തരത്തിനും L2-മാനം പ്ലോട്ട് ചെയ്തിരിക്കുന്നു. റണ്ണിന്റെ അതിരുകൾ ഡാഷ് ഉപയോഗിച്ച് സൂചിപ്പിച്ചിരിക്കുന്നു
ലംബ വരകൾ. ഇനിപ്പറയുന്ന സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കുകൾ ദൃശ്യവൽക്കരിച്ചിട്ടുണ്ട്

1. ഇളം ചാരനിറത്തിലുള്ള ഷേഡുള്ള പ്രദേശത്തോടുകൂടിയ വിഷയങ്ങളിലുടനീളം (മിനിറ്റ്, പരമാവധി) ശ്രേണി

2. ഇടത്തരം ചാര ഷേഡുള്ള പ്രദേശത്തോടുകൂടിയ ശരാശരിക്ക് ചുറ്റും 50% ശതമാനം

3. ഇരുണ്ട ചാരനിറത്തിലുള്ള ഷേഡുള്ള പ്രദേശത്തോടുകൂടിയ ശരാശരിയുടെ (SEM; +/-) സാധാരണ പിശക്

4. കറുത്ത വരയുള്ള വിഷയങ്ങളിലുടനീളം മീഡിയൻ

5. ഔട്ട്‌ലിയർ വിഷയങ്ങളെ വ്യക്തിഗത ചുവന്ന വരകളായി പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു

ഒരു നിശ്ചിത ഓട്ടത്തിനുള്ളിൽ എവിടെയും പരിധി കവിയുന്ന വിഷയങ്ങളായി ഔട്ട്‌ലയറുകൾ നിർവചിക്കപ്പെടുന്നു. ഇൻ
അങ്ങനെയെങ്കിൽ, ആ റണ്ണിനായുള്ള മുഴുവൻ ചലന സമയ ശ്രേണിയും ഒരു ഔട്ട്‌ലിയർ ആയി പ്ലോട്ട് ചെയ്തിരിക്കുന്നു. എന്നതിനുള്ള ഐഡികൾ
കണ്ടെത്തിയ ഔട്ട്‌ലറുകൾ കൺസോളിലേക്ക് പ്രിന്റ് ചെയ്യുന്നു. ഈ ഐഡികൾ കണക്കിലെടുക്കുന്നില്ല എന്നത് ശ്രദ്ധിക്കുക
ഡാറ്റ നഷ്‌ടമായി അല്ലെങ്കിൽ ഒഴിവാക്കിയ വിഷയങ്ങൾ. എന്നിരുന്നാലും, നഷ്‌ടമായ ഡാറ്റ ഇല്ലെങ്കിൽ ഒഴിവാക്കിയിട്ടില്ല
അവർ ചെയ്യുന്ന വിഷയങ്ങൾ സംഖ്യാ വിഷയ ഐഡികളുമായി പൊരുത്തപ്പെടുന്നു.

ഓപ്ഷനുകൾ

--പതിപ്പ്
പ്രോഗ്രാമിന്റെ പതിപ്പും ലൈസൻസ് വിവരങ്ങളും കാണിച്ച് പുറത്തുകടക്കുക

-h, --സഹായിക്കൂ, --help-np
ഈ സഹായ സന്ദേശം കാണിച്ച് പുറത്തുകടക്കുക. --help-np ഒരു പേജറിന്റെ ഉപയോഗം ബലമായി പ്രവർത്തനരഹിതമാക്കുന്നു
സഹായം പ്രദർശിപ്പിക്കുന്നതിന്.

--പാത PATH
OpenFMRI ഡാറ്റാസെറ്റിന്റെ റൂട്ട് ഡയറക്ടറിയിലേക്കുള്ള പാത

-t ഐഡി, --ദൗത്യം ID
QC പ്ലോട്ടിനായുള്ള BOLD fMRI ഡാറ്റയുള്ള ടാസ്‌ക്കിന്റെ ഐഡി. സ്ഥിരസ്ഥിതി: 1

--എസ്റ്റിമേറ്റ്-ഫ്നെയിം NAME
ഓരോ BOLD ടാസ്‌ക് റൺ ഫോൾഡറിലും ചലന എസ്റ്റിമേറ്റ് ഉള്ള ഫയലുകളുടെ പേര്. ഡിഫോൾട്ട്:
bold_moest.txt

--ബന്ധു REF REF
റൺ Y-ൽ വോളിയം X-നുള്ള എസ്റ്റിമേറ്റിന്റെ വ്യത്യാസമായി എല്ലാ എസ്റ്റിമേറ്റുകളും റീകോഡ് ചെയ്യുക
(--ബന്ധു YX). പൂജ്യം അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള സൂചികകൾ!

--ഒഴിവാക്കുക-subjs ഞാന് ചെയ്തു ...]
QC വിശകലനത്തിൽ നിന്ന് ഒഴിവാക്കാനുള്ള ഇടം-വേർതിരിക്കപ്പെട്ട സജക്റ്റ് ഐഡികളുടെ ലിസ്റ്റ്

--എസ്റ്റിമേറ്റ്-ഓർഡർ LABEL
ഫയലുകളിലെ എസ്റ്റിമേറ്റുകളുടെ നിര ക്രമം. `ട്രാൻസ്‌റോട്ട്' ആദ്യം വിവർത്തനം സൂചിപ്പിക്കുന്നു,
തുടർന്ന് ഭ്രമണം. `rottrans` വിപരീത ക്രമത്തെ സൂചിപ്പിക്കുന്നു. ഡിഫോൾട്ട്: 'ട്രാൻസ്‌റോട്ട്'

--rad2deg
വ്യക്തമാക്കിയിട്ടുണ്ടെങ്കിൽ, റൊട്ടേഷൻ എസ്റ്റിമേറ്റുകൾ റേഡിയനിലാണെന്ന് അനുമാനിക്കുകയും അത് പരിവർത്തനം ചെയ്യുകയും ചെയ്യും
ഡിഗ്രി വരെ.

--outlier-minthresh OUTLIER_MINTHRESH
ഔട്ട്‌ലിയർ കണ്ടെത്തലിന്റെ ഏറ്റവും കുറഞ്ഞ പരിധി. ഇതിനേക്കാൾ വലിയ മൂല്യം മാത്രം
ത്രെഷോൾഡ് എന്നെങ്കിലും ഒരു ഔട്ട്‌ലിയർ ആയി കണക്കാക്കും. സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഒന്നുമില്ല

--outlier-stdthresh OUTLIER_STDTHRESH
ഔട്ട്‌ലിയർ കണ്ടെത്തലിനുള്ള സ്റ്റാൻഡേർഡ് ഡീവിയേഷന്റെ യൂണിറ്റുകളിലെ ഏറ്റവും കുറഞ്ഞ പരിധി. ഡിഫോൾട്ട്:
ഒന്നുമില്ല

--സേവ്ഫിഗ് സംരക്ഷിക്കുക
ക്യുസി ചിത്രം സംഭരിക്കാൻ ഫയലിന്റെ പേര്. സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഒന്നുമില്ല

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് pymvpa2-ofmotionqc ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക