SeqNoise - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

AmpliconNoise - ഉയർന്ന ത്രൂപുട്ട് ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് സീക്വൻസ് ഡാറ്റയിൽ നിന്ന് ശബ്ദം നീക്കം ചെയ്യുക

പതിപ്പ്

ഈ ഡോക്യുമെന്റേഷൻ പതിപ്പ് 1.22 സൂചിപ്പിക്കുന്നു

സിനോപ്സിസ്

കാണുക /usr/share/doc/ampliconnoise/Doc.pdf.gz എങ്ങനെ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം എന്നതിന്റെ വിശദാംശങ്ങൾക്ക്.

വിവരണം

ഇനിപ്പറയുന്ന ഉപകരണങ്ങൾ ഉൾപ്പെടുത്തിയിട്ടുണ്ട്. അവരിൽ ഭൂരിഭാഗത്തിനും MPI തത്തുല്യമാണ്, ഉദാഹരണത്തിന്
SeqNoise-ന് mpirun-നൊപ്പം ഉപയോഗിക്കാവുന്ന തുല്യമായ SeqNoiseM ഉണ്ട്.

ഫാസ്റ്റ യുണീക്ക് - ഫാസ്റ്റ ഫയലിനെ ഇല്ലാതാക്കുന്നു
-ഇൻ സ്ട്രിംഗ് ഇൻപുട്ട് ഫയലിന്റെ പേര്
ഓപ്ഷനുകൾ:

എഫ്സിക്ലസ്റ്റർ
-ഇൻ സ്ട്രിംഗ് ഡിസ്റ്റൻസ് ഇൻപുട്ട് ഫയലിന്റെ പേര്
-ഔട്ട് സ്ട്രിംഗ് ഔട്ട്പുട്ട് ഫയൽ അപൂർണ്ണം
ഓപ്ഷനുകൾ:
-r റെസലൂഷൻ
-ഒരു ശരാശരി ബന്ധം
-w ഭാരം ഉപയോഗിക്കുക
- ഞാൻ ഐഡന്റിഫയറുകൾ വായിച്ചു
-s സ്കെയിൽ ജില്ല.

NDist - ഒരു ഫാസ്റ്റ ഫയലിൽ നിന്ന് ജോടിയായി നീഡിൽമാൻ-വുൺഷ് സീക്വൻസ് ഡിസ്റ്റൻസ് മാട്രിക്സ്
-ഇൻ സ്ട്രിംഗ് ഫാറ്റ ഫയലിന്റെ പേര്
ഓപ്ഷനുകൾ:
-ഐ ഔട്ട്പുട്ട് ഐഡന്റിഫയറുകൾ

പെർസിയസ് - രാക്ഷസന്മാരെ കൊല്ലുന്നു
-sin string seq ഫയലിന്റെ പേര്
ഓപ്ഷനുകൾ:
-tin സ്ട്രിംഗ് റഫറൻസ് സീക്വൻസ് ഫയൽ
-ഒരു ഔട്ട്പുട്ട് വിന്യാസങ്ങൾ
-d അസന്തുലിതാവസ്ഥ ഉപയോഗിക്കുക
-rin സ്ട്രിംഗ് ലുക്ക്അപ്പ് ഫയലിന്റെ പേര്

പൈറോഡിസ്റ്റ് - ഫ്ലോഗ്രാമുകളിൽ നിന്ന് ജോഡിവൈസ് ഡിസ്റ്റൻസ് മാട്രിക്സ്
-ഇൻ സ്ട്രിംഗ് ഫ്ലോ ഫയലിന്റെ പേര്
-ഔട്ട് സ്റ്റബ് ഔട്ട് ഫയൽ സ്റ്റബ്
ഓപ്ഷനുകൾ:
-നി dat ഫയലിൽ സൂചികയില്ല
-rin സ്ട്രിംഗ് ലുക്ക്അപ്പ് ഫയലിന്റെ പേര്

പൈറോനോയിസ് - വിന്യാസങ്ങളില്ലാതെ ക്ലസ്റ്ററുകൾ ഫ്ലോഗ്രാമുകൾ
-din സ്ട്രിംഗ് ഫ്ലോ ഫയലിന്റെ പേര്
-ഔട്ട് സ്ട്രിംഗ് ക്ലസ്റ്റർ ഇൻപുട്ട് ഫയലിന്റെ പേര്
-ലിൻ സ്ട്രിംഗ് ലിസ്റ്റ് ഫയൽ
ഓപ്ഷനുകൾ:
-വി വാചാലമായ
-സി ഇരട്ട പ്രാരംഭ കട്ട് ഓഫ്
-നി dat ഫയലിൽ സൂചികയില്ല
-s ഇരട്ട കൃത്യത
-rin ഫയൽ ലുക്ക്അപ്പ് ഫയലിന്റെ പേര്

SeqDist - ഒരു ഫാസ്റ്റ ഫയലിൽ നിന്ന് ജോഡിവൈസ് ഡിസ്റ്റൻസ് മാട്രിക്സ്
-ഇൻ സ്ട്രിംഗ് ഫാസ്റ്റ ഫയലിന്റെ പേര്
ഓപ്ഷനുകൾ:
-ഐ ഔട്ട്പുട്ട് ഐഡന്റിഫയറുകൾ
-rin സ്ട്രിംഗ് ലുക്ക്അപ്പ് ഫയലിന്റെ പേര്

SeqNoise - ക്ലസ്റ്റേഴ്സ് സീക്വൻസുകൾ
-ഇൻ സ്ട്രിംഗ് സീക്വൻസ് ഫയലിന്റെ പേര്
-din സ്ട്രിംഗ് ദൂരം മാട്രിക്സ് ഫയലിന്റെ പേര്
-ഔട്ട് സ്ട്രിംഗ് ക്ലസ്റ്റർ ഇൻപുട്ട് ഫയലിന്റെ പേര്
-ലിൻ സ്ട്രിംഗ് ലിസ്റ്റ് ഫയൽ
ഓപ്ഷനുകൾ:
-മിനിറ്റ് മാപ്പിംഗ് ഫയൽ
-വി വാചാലമായ
-സി ഇരട്ട പ്രാരംഭ കട്ട് ഓഫ്
-s ഇരട്ട കൃത്യത
-rin സ്ട്രിംഗ് ലുക്ക്അപ്പ് ഫയലിന്റെ പേര്

SplitClusterEven
-din string dat ഫയലിന്റെ പേര്
-മിനിറ്റ് സ്ട്രിംഗ് മാപ്പ് ഫയലിന്റെ പേര്
-tin സ്ട്രിംഗ് ട്രീ ഫയലിന്റെ പേര്
-s സ്പ്ലിറ്റ് സൈസ്
-m മിനിറ്റ് വലിപ്പം

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് SeqNoise ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക