Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാവുന്ന കമാൻഡ് സിന്ഡെക്‌സ് ആണിത്.
പട്ടിക:
NAME
sindex - sfech-നുള്ള ഒരു സീക്വൻസ് ഡാറ്റാബേസ് സൂചിക
സിനോപ്സിസ്
സിൻഡക്സ് [ഓപ്ഷനുകൾ] seqfile1 [seqfile2...]
വിവരണം
സിൻഡക്സ് ഒന്നോ അതിലധികമോ സൂചികകൾ seqfiles ഭാവിയിലെ ക്രമം വീണ്ടെടുക്കലുകൾക്കായി കണ്ടെത്തുക. ഒരു എസ്.എസ്.ഐ
("squid sequence index") ഫയൽ സീക്വൻസ് ഫയലുകൾക്കൊപ്പം ഒരേ ഡയറക്‌ടറിയിൽ സൃഷ്‌ടിക്കപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു. വഴി
സ്ഥിരസ്ഥിതിയായി, ഈ ഫയലിനെ വിളിക്കുന്നു .ssi.
കമാൻഡ് ലൈനിൽ ഒന്നിൽ കൂടുതൽ സീക്വൻസ് ഫയലുകൾ ഉണ്ടെങ്കിൽ, SSI ഫയലിന്റെ പേര് ഇതായിരിക്കും
അവസാന സീക്വൻസ് ഫയൽ നാമത്തിൽ നിന്നാണ് നിർമ്മിച്ചിരിക്കുന്നത്. നിങ്ങൾ ആഗ്രഹിക്കുന്നത് ഇതായിരിക്കില്ല; കാണുക -o
SSI ഫയലിനായി നിങ്ങളുടെ സ്വന്തം പേര് വ്യക്തമാക്കുന്നതിനുള്ള ഓപ്ഷൻ.
സിൻഡക്സ് ഓപ്ഷണൽ LFS പിന്തുണ പ്രവർത്തനക്ഷമമാക്കിയിട്ടുണ്ടെങ്കിൽ വലിയ ഫയലുകൾ (>2 GB) സൂചികയിലാക്കാൻ കഴിയും
കംപൈൽ സമയത്ത്. @PACKAGE@ എന്നതിനൊപ്പം വന്ന ഇൻസ്‌റ്റാൾ നിർദ്ദേശങ്ങൾ കാണുക.
ഓപ്ഷനുകൾ
-h പ്രിന്റ് ഹ്രസ്വ സഹായം; പതിപ്പ് നമ്പറും ഉൾപ്പെടെ എല്ലാ ഓപ്ഷനുകളുടെയും സംഗ്രഹവും ഉൾപ്പെടുന്നു
വിദഗ്ധ ഓപ്ഷനുകൾ.
-o <ssi outfile>
പേരുള്ള ഒരു ഫയലിലേക്ക് SSI സൂചിക നയിക്കുക . സ്ഥിരസ്ഥിതിയായി, SSI ഫയൽ പോകും
ലേക്ക് .ssi.
പരീക്ഷണം ഓപ്ഷനുകൾ
--64 SSI ഫയൽ 64-ബിറ്റ് (വലിയ seqfile) മോഡിലേക്ക് നിർബന്ധിക്കുക, seqfile ചെറുതാണെങ്കിൽ പോലും.
നിങ്ങൾ ഡീബഗ്ഗിംഗ് ചെയ്യുന്നില്ലെങ്കിൽ ഇത് ചെയ്യാൻ നിങ്ങൾ ആഗ്രഹിക്കുന്നില്ല.
--ബാഹ്യ
ശക്തിയാണ് സിൻഡക്സ് എക്‌സ്‌റ്റേണൽ (ഓൺ-ഡിസ്ക്) സോർട്ടിംഗ് വഴി അതിന്റെ റെക്കോർഡ് സോർട്ടിംഗ് ചെയ്യാൻ. ഇത് മാത്രം
ഡീബഗ്ഗിംഗിനും ഉപയോഗപ്രദമാണ്.
--വിവരങ്ങൾ
സീക്വൻസ് ഫയൽ തീർച്ചയായും ഫോർമാറ്റിലാണെന്ന് വ്യക്തമാക്കുക ; സീക്വൻസ് ഫയൽ തടയുന്നു
ഫോർമാറ്റ് ഓട്ടോഡിറ്റക്ഷൻ. ഓട്ടോമേറ്റഡ് പൈപ്പ്ലൈനുകളിൽ ഇത് ഉപയോഗപ്രദമാണ്, കാരണം ഇത് മെച്ചപ്പെടുന്നു
ദൃഢത (വിപരീതമായി വികലമായ ഒരു വ്യക്തിയിൽ യാന്ത്രിക കണ്ടുപിടിത്തം ചിലപ്പോൾ തെറ്റായി സംഭവിക്കാം
ഫയൽ). സാധാരണ ഉദാഹരണങ്ങളിൽ genbank, embl, gcg, pir, stockholm, clustal, msf, അല്ലെങ്കിൽ
ഫിലിപ്; സ്വീകാര്യമായ ഫോർമാറ്റ് പേരുകളുടെ പൂർണ്ണമായ ലിസ്റ്റിനായി അച്ചടിച്ച ഡോക്യുമെന്റേഷൻ കാണുക.
--pfamseq
Pfam-ന് ഒരു ഹാക്ക്; ഐഡന്റിഫയർ ലൈനുകൾ ഉള്ളതായി അറിയപ്പെടുന്ന ഒരു ഫാസ്റ്റ ഫയലിനെ സൂചികയിലാക്കുന്നു
ഫോർമാറ്റ് ">[പേര്] [പ്രവേശനം] [ഓപ്ഷണൽ വിവരണം]". സാധാരണയായി ക്രമം മാത്രം
ഒരു FASTA SSI ഫയലിൽ ഒരു പ്രാഥമിക കീ ആയി പേര് സൂചികയിലാക്കപ്പെടും, എന്നാൽ ഇത് അനുവദിക്കുന്നു
പേര് (ഒരു പ്രാഥമിക കീ ആയി), പ്രവേശനം (ഒരു ദ്വിതീയ കീ ആയി) എന്നിവ സൂചികയിലാക്കുന്നു.
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് sindex ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക