Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാൻ കഴിയുന്ന കമാൻഡ് ടാന്റണാണിത്.
പട്ടിക:
NAME
ടാൻടാൻ - കുറഞ്ഞ സങ്കീർണ്ണതയും ബയോസെക്വൻസുകൾക്കായുള്ള ടാൻഡം റിപ്പീറ്റ് മാസ്കറും
സിനോപ്സിസ്
തന്തൻ [ഓപ്ഷനുകൾ] fasta-sequence-file(s)
വിവരണം
ക്രമങ്ങളിൽ ലളിതമായ ആവർത്തനങ്ങൾ കണ്ടെത്തുക
ഓപ്ഷനുകൾ (സ്ഥിരസ്ഥിതി ക്രമീകരണങ്ങൾ):
-p ക്രമങ്ങളെ പ്രോട്ടീനുകളായി വ്യാഖ്യാനിക്കുക
-x ചെറിയക്ഷരത്തിനുപകരം മുഖംമൂടിക്ക് ഉപയോഗിക്കാനുള്ള കത്ത്
-c മുഖംമൂടിയില്ലാത്ത പ്രദേശങ്ങളിൽ വലിയക്ഷരം/ചെറിയ അക്ഷരങ്ങൾ സൂക്ഷിക്കുക
-m അക്ഷര ജോടി സ്കോറുകൾക്കുള്ള ഫയൽ (+1/-1, പക്ഷേ -p BLOSUM62 തിരഞ്ഞെടുക്കുന്നു)
-r ഓരോ സ്ഥാനവും ആവർത്തിക്കാനുള്ള സാധ്യത (0.005)
-e ഓരോ സ്ഥാനത്തിനും ആവർത്തിച്ചുള്ള അവസാനത്തിന്റെ സംഭാവ്യത (0.05)
-w പരിഗണിക്കേണ്ട പരമാവധി ടാൻഡം ആവർത്തന കാലയളവ് (100, പക്ഷേ -p 50 തിരഞ്ഞെടുക്കുന്നു)
-d ഓരോ കാലയളവിലും പ്രോബബിലിറ്റി ശോഷണം (0.9)
-a വിടവ് അസ്തിത്വ ചെലവ് (0)
-b വിടവ് വിപുലീകരണ ചെലവ് (അനന്തം: വിടവുകളില്ല)
-s മറയ്ക്കുന്നതിനുള്ള ഏറ്റവും കുറഞ്ഞ ആവർത്തന സാധ്യത (0.5)
-f ഔട്ട്പുട്ട് തരം: 0=മാസ്ക്ഡ് സീക്വൻസ്, 1=ആവർത്തന സാധ്യതകൾ,
2=ആവർത്തന എണ്ണങ്ങൾ, 3=BED (0)
-h, --സഹായിക്കൂ
സഹായ സന്ദേശം കാണിക്കുക, തുടർന്ന് പുറത്തുകടക്കുക
--പതിപ്പ്
പതിപ്പ് വിവരങ്ങൾ കാണിക്കുക, തുടർന്ന് പുറത്തുകടക്കുക
റിപ്പോർട്ടുചെയ്യുന്നു ബഗുകൾ
ഇതിലേക്ക് ബഗുകൾ റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യുക: [ഇമെയിൽ പരിരക്ഷിച്ചിരിക്കുന്നു]
ഹോം പേജ്: http://www.cbrc.jp/tantan/
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് ടാന്റൻ ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക