ഇതാണ് CIMS എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന Linux ആപ്പ്, ഇതിന്റെ ഏറ്റവും പുതിയ റിലീസ് CIMS.v1.0.5.tgz ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക്‌സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
CIMS എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് OnWorks-നൊപ്പം സൗജന്യമായി ഓൺലൈനായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്‌ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് OnWorks Linux ഓൺലൈനോ Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ MACOS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ ആരംഭിക്കുക.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Linux OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, അത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
സ്ക്രീൻഷോട്ടുകൾ
Ad
സിഐഎംഎസ്
വിവരണം
HITS-CLIP ഡാറ്റയിൽ നിന്ന് സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കനുസരിച്ച് പുനരുൽപ്പാദിപ്പിക്കാവുന്ന ക്രോസ്‌ലിങ്കിംഗ് ഇൻഡുസ്ഡ് മ്യൂട്ടേഷൻ സൈറ്റുകളും (CIMS) ക്രോസ് ലിങ്കിംഗ് ഇൻഡുസ്ഡ് ട്രങ്കേഷൻ സൈറ്റുകളും (CITS) കണ്ടെത്തുന്നതിനുള്ള സ്‌ക്രിപ്റ്റുകൾ ഈ പാക്കേജിൽ ഉൾപ്പെടുന്നു.
അവലംബം:
Moore, M.*, Zhang, C.*, Gantman, EC, Mele, A., Darnell, JC, Darnell, RB 2014. മാപ്പിംഗ് Argonaute, HITS-CLIP ഉപയോഗിച്ച് സിംഗിൾ-ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് റെസല്യൂഷനിൽ ആർഎൻഎയുമായുള്ള പരമ്പരാഗത RNA-ബൈൻഡിംഗ് പ്രോട്ടീൻ ഇടപെടലുകൾ കൂടാതെ CIMS വിശകലനവും. നാറ്റ് പ്രോട്ടോക്കോളുകൾ, 9:263-293.
Zhang,C.†, Darnell, RB† 2011. HITS-CLIP ഡാറ്റയിൽ നിന്നുള്ള സിംഗിൾ-ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് റെസല്യൂഷനിൽ vivo പ്രോട്ടീൻ-RNA ഇടപെടലുകളിൽ മാപ്പിംഗ്. നാറ്റ്. ബയോടെക്. 29:607-614.
സവിശേഷതകൾ
- മാപ്പിംഗ് റോ CLIP റഫറൻസ് ജീനോമിലേക്ക് വായിക്കുന്നു (നോവോഅലൈൻ ഉപയോഗിച്ച്)
- ക്രമരഹിതമായ ബാർകോഡുകളുടെ സാന്നിധ്യത്തെ ആശ്രയിച്ച് വ്യത്യസ്‌ത മോഡലുകളുള്ള പിസിആർ ഡ്യൂപ്ലിക്കേറ്റുകൾ തകർക്കുന്നു
- ക്ലസ്റ്ററുകൾ തിരിച്ചറിയുന്നതിനും പീക്ക് ഉയരം നിർണ്ണയിക്കുന്നതിനും ക്ലസ്റ്റർ CLIP ടാഗുകൾ
- അദ്വിതീയ CLIP ടാഗുകളിൽ ട്രാക്കിംഗ് മ്യൂട്ടേഷനുകൾ (ഇൻസേർഷനുകൾ, ഇല്ലാതാക്കലുകൾ, പകരം വയ്ക്കലുകൾ)
- റോബസ്റ്റ് ക്രോസ് ലിങ്കിംഗ് ഇൻഡുസ്ഡ് മ്യൂട്ടേഷൻ സൈറ്റുകൾ (CIMS) തിരിച്ചറിയൽ
- BrdU-CLIP, iCLIP അല്ലെങ്കിൽ മറ്റ് സമാന വ്യതിയാനങ്ങളിൽ നിന്ന് ശക്തമായ ക്രോസ് ലിങ്കിംഗ് ഇൻഡ്യൂസ്ഡ് ട്രങ്കേഷൻ സൈറ്റുകൾ (CITS) തിരിച്ചറിയൽ
പ്രേക്ഷകർ
വിപുലമായ അന്തിമ ഉപയോക്താക്കൾ
ഉപയോക്തൃ ഇന്റർഫേസ്
കമാൻഡ്-ലൈൻ
പ്രോഗ്രാമിംഗ് ഭാഷ
പേൾ
Categories
ഇത് https://sourceforge.net/projects/ngs-cims/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണ്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.
