ഇതാണ് MCPerm എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന Linux ആപ്പ്: Monte Carlo SNP പെർമ്യൂട്ടേഷൻ ഓൺലൈനായി Linux-ൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനുള്ള ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് MCPerm_1.1.2.tar.gz ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക് സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
MCPerm എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് ഓൺലൈനായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക: OnWorks-ൽ സൗജന്യമായി Linux-ൽ പ്രവർത്തിക്കാൻ Monte Carlo SNP പെർമ്യൂട്ടേഷൻ.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്‌ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് OnWorks Linux ഓൺലൈനോ Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ MACOS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ ആരംഭിക്കുക.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Linux OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, അത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
MCPerm: Monte Carlo SNP പെർമ്യൂട്ടേഷൻ ഓൺലൈനിൽ Linux-ൽ പ്രവർത്തിക്കും
Ad
വിവരണം
MCPerm: കേസ് കൺട്രോൾ അസോസിയേഷൻ പഠനത്തിൽ ഒന്നിലധികം ടെസ്റ്റ് കോറിലേഷനുള്ള ഒരു മോണ്ടെ കാർലോ പെർമ്യൂട്ടേഷൻ രീതിപരമ്പരാഗത പെർമ്യൂട്ടേഷൻ (TradPerm) ടെസ്റ്റ് എന്നത് ഒരു പ്രധാന നോൺ-പാരാമെട്രിക് വിശകലന രീതിയാണ്, ഇത് കേസ് കൺട്രോൾ അസോസിയേഷൻ പഠനത്തിലെ ഒന്നിലധികം ടെസ്റ്റിംഗ് തിരുത്തലുകൾക്കുള്ള സ്വർണ്ണ നിലവാരമായി കണക്കാക്കാം. എന്നിരുന്നാലും, ധാരാളം ക്രമരഹിതമായ ഷഫിളുകൾ നടത്താൻ ഇത് യഥാർത്ഥ സിംഗിൾ ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് പോളിമോർഫിസം (എസ്എൻപി) ജനിതകരൂപങ്ങളെയും ഫിനോടൈപ്പ് ഡാറ്റയെയും ആശ്രയിക്കുന്നു, അതിനാൽ ഇത് കമ്പ്യൂട്ടേഷണൽ തീവ്രമാണ്, പ്രത്യേകിച്ച് ജീനോം വൈഡ് അസോസിയേഷൻ പഠനത്തിന് (GWAS). TradPerm p-value യുടെ വലുപ്പം മാറ്റാതെ തന്നെ കണക്കുകൂട്ടൽ വേഗത മെച്ചപ്പെടുത്തുന്നതിന്, TradPerm-ന് കാര്യക്ഷമമായ ഒരു ബദലായി ഞങ്ങൾ മോണ്ടെ കാർലോ പെർമുറ്റേഷൻ (MCPerm) രീതി വികസിപ്പിച്ചെടുത്തു.
രീതികൾ: MCPerm-ന് യഥാർത്ഥ ജനിതകരൂപങ്ങളുടെയും ഫിനോടൈപ്പുകളുടെയും ഡാറ്റ ഷഫിൾ ചെയ്യേണ്ടതില്ല. ഇത് മോണ്ടെ കാർലോ രീതി ഉപയോഗിക്കുന്നു, കേസുകളിലും നിയന്ത്രണങ്ങളിലും ജനിതകമാതൃകകളുടെ ക്രമരഹിതമായ എണ്ണം (AA, Aa, aa) സൃഷ്ടിക്കുന്നതിന് രണ്ട്-ഘട്ട ഹൈപ്പർജിയോമെട്രിക് വിതരണം ഉപയോഗിക്കുന്നു.
പ്രോഗ്രാമിംഗ് ഭാഷ
എസ്/ആർ
ഇത് https://sourceforge.net/projects/mcperm/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണ്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.
