Meraculous-2D എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന Linux ആപ്പാണിത്, ഇതിന്റെ ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് Meraculous-v2.2.6.tar.gz ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക് സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
Meraculous-2D എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് OnWorks-ൽ സൗജന്യമായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് OnWorks Linux ഓൺലൈനോ Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ MACOS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ ആരംഭിക്കുക.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Linux OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, അത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
സ്ക്രീൻഷോട്ടുകൾ:
മെറാക്കുലസ്-2ഡി
വിവരണം:
----------------------------------------
പ്രധാനം: Meraculous-2D ഹിപ്മെർ അസംബ്ലർ അസാധുവാക്കിയിരിക്കുന്നു, ഇവിടെ ലഭ്യമാണ്: https://sourceforge.net/projects/hipmer/
-----------------------------------------
മെറാക്കുലസ്-2D എന്നത് NGS റീഡുകൾക്കുള്ള (ഇല്ലുമിന) ഒരു ജീനോം അസംബ്ലറാണ്, അത് മിതമായ കമ്പ്യൂട്ടേഷണൽ ആവശ്യകതകളോടെ വലിയ, ഡിപ്ലോയിഡ് ജീനോമുകൾ കൂട്ടിച്ചേർക്കാൻ പ്രാപ്തമാണ്. സവിശേഷതകൾ ഉൾപ്പെടുന്നു:
- കാര്യക്ഷമമായ k-mer കൗണ്ടിംഗും deBruijn ഗ്രാഫ് ട്രാവേഴ്സലും
- ഡിപ്ലോയിഡ് അല്ലെലിക് വ്യത്യാസം കൈകാര്യം ചെയ്യുന്നതിനുള്ള രണ്ട് രീതികൾ
- സ്കാർഫോൾഡിംഗ് കൃത്യതയിൽ വിട്ടുവീഴ്ച ചെയ്യാതെ കൂടുതൽ പൂർണ്ണമായ അസംബ്ലികൾ നിർമ്മിക്കുന്ന മെച്ചപ്പെടുത്തിയ സ്കാർഫോൾഡിംഗ്.
ഒരു GE/SLURM-ടൈപ്പ് ക്ലസ്റ്ററിലോ സ്റ്റാൻഡേലോൺ മൾട്ടി-കോർ സെർവറിലോ ഒന്നിലധികം ടാസ്ക് അറേകളുടെ സമർപ്പണവും നിരീക്ഷണവും കൂടാതെ ഡാറ്റാ ഫ്രാഗ്മെന്റേഷനും ലോഡ് ബാലൻസിംഗും നിർവ്വഹിക്കുന്ന ഒരു പേൾ പൈപ്പ്ലൈനാണ് അസംബ്ലിയെ നയിക്കുന്നത്.
സമർപ്പിക്കുന്ന കൈയെഴുത്തുപ്രതികൾ:
https://arxiv.org/abs/1703.09852
https://arxiv.org/abs/1608
സവിശേഷതകൾ
- യൂക്കറിയോട്ടിക് ജീനോം അസംബ്ലി
- ഉയർന്നതും താഴ്ന്നതുമായ ഹെറ്ററോസൈഗോസിറ്റി ജനിതകഘടനയ്ക്കുള്ള പ്രത്യേക മോഡുകൾ
- ബിൽറ്റ്-ഇൻ ഡിസ്ട്രിബ്യൂഡ് എക്സിക്യൂഷൻ
- കാര്യക്ഷമമായ k-mer ബഹിരാകാശ പ്രവർത്തനങ്ങൾ
- സിംഗിൾ-സെർവർ, ക്ലസ്റ്റർ-റെഡി വിന്യാസം (AWS-റെഡി)
പ്രേക്ഷകർ
ശാസ്ത്രം/ഗവേഷണം
ഉപയോക്തൃ ഇന്റർഫേസ്
കമാൻഡ്-ലൈൻ
പ്രോഗ്രാമിംഗ് ഭാഷ
പേൾ, സി++
Categories
ഇത് https://sourceforge.net/projects/meraculous20/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണ്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്തിരിക്കുന്നു.