OpenFold എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ലിനക്സ് ആപ്പാണിത്, ഇതിന്റെ ഏറ്റവും പുതിയ റിലീസ് OpenFoldv1.0.1.zip ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
OpenFold with OnWorks എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് സൗജന്യമായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്‌ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് OnWorks Linux ഓൺലൈനോ Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ MACOS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ ആരംഭിക്കുക.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Linux OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, അത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
സ്ക്രീൻഷോട്ടുകൾ
Ad
ഓപ്പൺഫോൾഡ്
വിവരണം
യഥാർത്ഥ ഓപ്പൺ സോഴ്‌സ് അനുമാന കോഡിന്റെ (v2.0.1) എല്ലാ സവിശേഷതകളും OpenFold ശ്രദ്ധാപൂർവ്വം പുനർനിർമ്മിക്കുന്നു (ഏതാണ്ട്). ഡീപ്‌മൈൻഡിന്റെ സ്വന്തം അബ്ലേഷൻ ടെസ്റ്റിംഗിൽ മോശം പ്രകടനം കാഴ്ചവെച്ച മോഡൽ എൻസെംബ്ലിംഗ് മാത്രമാണ് ഏക അപവാദം, ഭാവിയിലെ ഡീപ്‌മൈൻഡ് പരീക്ഷണങ്ങളിൽ ഇത് ഘട്ടംഘട്ടമായി ഒഴിവാക്കുകയാണ്. അത് ഇവിടെ ഒഴിവാക്കിയത് വൃത്തികേട് കുറയ്ക്കാൻ വേണ്ടിയാണ്. നേച്ചർ പേപ്പർ ഉറവിടത്തിൽ നിന്ന് വ്യത്യസ്തമാകുന്ന സന്ദർഭങ്ങളിൽ, ഞങ്ങൾ എല്ലായ്പ്പോഴും രണ്ടാമത്തേതിലേക്ക് മാറ്റിവയ്ക്കുന്നു. ഡീപ്‌സ്പീഡ് ഉപയോഗിച്ചോ അല്ലാതെയോ പൂർണ്ണ കൃത്യതയിലും പകുതി കൃത്യതയിലും അല്ലെങ്കിൽ bfloat16-ലും ഓപ്പൺഫോൾഡ് പരിശീലിപ്പിക്കാവുന്നതാണ്, ഒറിജിനലിന്റെ പ്രകടനവുമായി പൊരുത്തപ്പെടുന്ന, ആദ്യം മുതൽ ഞങ്ങൾ ഇത് പരിശീലിപ്പിച്ചിട്ടുണ്ട്. അനുവദനീയമായ ലൈസൻസിന് കീഴിൽ ഞങ്ങൾ മോഡൽ വെയ്റ്റുകളും ഞങ്ങളുടെ പരിശീലന ഡാറ്റയും പരസ്യമായി പുറത്തിറക്കിയിട്ടുണ്ട് - ഏകദേശം 400,000 MSA-കളും PDB70 ടെംപ്ലേറ്റുകളും ഹിറ്റ് ഫയലുകൾ. AWS-ലെ (RODA) രജിസ്ട്രി ഓഫ് ഓപ്പൺ ഡാറ്റയാണ് MSA-കൾ ഹോസ്റ്റുചെയ്യുമ്പോൾ, ഈ ശേഖരത്തിലെ സ്ക്രിപ്റ്റുകൾ വഴി മോഡൽ വെയ്റ്റുകൾ ലഭ്യമാണ്.
സവിശേഷതകൾ
- ജിപിയുവിൽ വേഗത്തിലുള്ള അനുമാനം, ചിലപ്പോൾ 2x വരെ
- വളരെ ദൈർഘ്യമേറിയ ശൃംഖലകളെക്കുറിച്ചുള്ള അനുമാനം, ഞങ്ങളുടെ ലോ-മെമ്മറി ശ്രദ്ധ നടപ്പിലാക്കുന്നതിലൂടെ സാധ്യമായതാണ്
- ഫാസ്റ്റ്ഫോൾഡിന്റെ കേർണലുകളിൽ നിന്ന് പരിഷ്കരിച്ച ഇഷ്‌ടാനുസൃത CUDA ശ്രദ്ധ കേർണലുകൾ അനുമാനത്തിലും പരിശീലനത്തിലും ശ്രദ്ധ കേന്ദ്രീകരിക്കുന്നതിന് പിന്തുണ നൽകുന്നു
- യഥാർത്ഥ ആൽഫഫോൾഡ് HHblits/JackHMMER പൈപ്പ്ലൈൻ അല്ലെങ്കിൽ ColabFold's ഉപയോഗിച്ച് കാര്യക്ഷമമായ അലൈൻമെന്റ് സ്ക്രിപ്റ്റുകൾ
- FlashAttention പിന്തുണ MSA ശ്രദ്ധയെ വളരെയധികം വേഗത്തിലാക്കുന്നു
- ആൽഫഫോൾഡിന്റെ ഔദ്യോഗിക പാരാമീറ്ററുകൾ ഉപയോഗിച്ചുള്ള അനുമാനത്തെ OpenFold പിന്തുണയ്ക്കുന്നു
പ്രോഗ്രാമിംഗ് ഭാഷ
പൈത്തൺ
Categories
ഇത് https://sourceforge.net/projects/openfold.mirror/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണ്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.
