ഇതാണ് P3BSseq എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന Linux ആപ്പ്, ഇതിന്റെ ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് P3BSseq_v2.1.zip ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
P3BSseq എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് OnWorks-നൊപ്പം സൗജന്യമായി ഓൺലൈനായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്‌ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് OnWorks Linux ഓൺലൈനോ Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ MACOS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ ആരംഭിക്കുക.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Linux OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, അത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
സ്ക്രീൻഷോട്ടുകൾ
Ad
P3BSseq
വിവരണം
Bisulfite sequencing (BSseq) പ്രോസസ്സിംഗ് ഏറ്റവും ബുദ്ധിമുട്ടുള്ള അടുത്ത തലമുറ സീക്വൻസിംഗ് (NGS) ആപ്ലിക്കേഷനുകളിൽ ഒന്നാണ്. ചില BSseq പ്രോസസ്സിംഗ് ടൂളുകൾ ലഭ്യമാണെങ്കിലും, അവ ചിതറിക്കിടക്കുന്നു, ആശയക്കുഴപ്പമുണ്ടാക്കുന്ന പാരാമീറ്ററുകൾ ആവശ്യമാണ്, കൂടാതെ പ്രവർത്തന സമയവും മെമ്മറി-ഉപയോഗവും ആവശ്യപ്പെടുന്നു. ഞങ്ങൾ P3BSseq വികസിപ്പിച്ചെടുത്തിട്ടുണ്ട്, BSseq ന്റെ വേഗതയേറിയതും കൃത്യവും സ്വയമേവയുള്ളതുമായ വിശകലനത്തിനായി ഒരു സമാന്തര പ്രോസസ്സിംഗ് പൈപ്പ്ലൈൻ വികസിപ്പിച്ചെടുത്തു, അത് ട്രിം ചെയ്യുന്നു, വിന്യസിക്കുന്നു, വ്യാഖ്യാനിക്കുന്നു, ഇന്റർമീഡിയറ്റ് ഫലങ്ങൾ രേഖപ്പെടുത്തുന്നു, bisulfite പരിവർത്തന ഗുണനിലവാര വിലയിരുത്തൽ നടത്തുന്നു, BED methylome സൃഷ്ടിക്കുന്നു, NIH മാനദണ്ഡങ്ങൾ പാലിച്ച് ഫയലുകൾ റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യുന്നു. പ്രവർത്തന സമയം, കമ്പ്യൂട്ടർ ഹാർഡ്‌വെയർ ആവശ്യകതകൾ എന്നിവയിൽ അറിയപ്പെടുന്ന BSseq മാപ്പർമാരെ P3BSseq മറികടക്കുന്നു. ഞങ്ങൾ P3BSseq പാരാമീറ്ററുകൾ ദിശാസൂചകവും അല്ലാത്തതുമായ ലൈബ്രറികൾക്കായി ഒപ്റ്റിമൈസ് ചെയ്തു, കൂടാതെ ഹോൾ ജീനോമിന്റെയും റിഡ്യൂസ്ഡ് റെപ്രസന്റേഷന്റെയും BSseq-ന്റെ സിംഗിൾ-എൻഡ്, പെയർ-എൻഡ് റീഡുകൾക്കായി. BSseq അപ്‌സ്‌ട്രീം വിശകലനത്തിനുള്ള ഉപയോക്തൃ-സൗഹൃദ സ്ട്രീംലൈൻഡ് സൊല്യൂഷനാണ് P3BSseq, അടിസ്ഥാന കമ്പ്യൂട്ടറും NGS പരിജ്ഞാനവും മാത്രം ആവശ്യമാണ്.
സവിശേഷതകൾ
- അടുത്ത തലമുറ സീക്വൻസിംഗ് (NGS) ഡാറ്റ പ്രോസസ്സിംഗ്
- ഡിഎൻഎ മെത്തിലോമിക്സ് വിശകലനം
- സമാന്തര പ്രോസസ്സിംഗ്
- ബിസൾഫൈറ്റ് സീക്വൻസിംഗിന്റെ (ആർആർബിഎസ്) കുറഞ്ഞ പ്രാതിനിധ്യം
പ്രേക്ഷകർ
ശാസ്ത്രം/ഗവേഷണം
ഉപയോക്തൃ ഇന്റർഫേസ്
കൺസോൾ/ടെർമിനൽ
പ്രോഗ്രാമിംഗ് ഭാഷ
പൈത്തൺ
Categories
https://sourceforge.net/projects/p3bsseq/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണിത്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.
