Linux-നായി sgRNAcas9 ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യുക

ഇതാണ് sgRNAcas9 എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന Linux ആപ്പ്, ഇതിൻ്റെ ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് sgRNAcas9_3.0.5.zip ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.

സ്ക്രീൻഷോട്ടുകൾ

sgRNAcas9

വിവരണം

ഉപയോക്തൃ-നിർവചിച്ച പാരാമീറ്ററുകൾ ഉപയോഗിച്ച് CRISPR ടാർഗെറ്റ് സൈറ്റുകൾക്കായി (പ്രോട്ടോസ്‌പേസറുകൾ) ഒരു തിരയൽ നടത്തുന്നതിനുള്ള പ്രോഗ്രാമുകൾ ഈ പാക്കേജിൽ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു, ജീനോം-വൈഡ് Cas9 സാധ്യതയുള്ള ഓഫ്-ടാർഗെറ്റ് ക്ലീവേജ് സൈറ്റുകൾ (POT), POT-യെ മൂന്ന് വിഭാഗങ്ങളായി തരംതിരിക്കുക, 20 നിർമ്മിക്കുന്നതിനുള്ള ബാച്ച് ഡിസൈൻ ഒലിഗോ ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകൾ -nt (ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകൾ) അല്ലെങ്കിൽ വെട്ടിച്ചുരുക്കിയ sgRNA എക്സ്പ്രഷൻ വെക്‌ടറുകൾ, T7E1 ക്ലീവേജ് അസ്‌സെ വഴി മ്യൂട്ടേഷനുകൾ സാധൂകരിക്കുന്നതിന് PCR പ്രൈമർ ജോഡികൾ രൂപകൽപ്പന ചെയ്യുന്നതിനായി ഓൺ അല്ലെങ്കിൽ ഓഫ്-ടാർഗെറ്റ് ക്ലിവേജ് സൈറ്റുകൾക്ക് അരികിലുള്ള ആവശ്യമുള്ള നീളമുള്ള ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് സീക്വൻസുകൾ എക്‌സ്‌ട്രാക്റ്റുചെയ്യുക. പ്രധാനമായി, സിലിക്കോയിൽ സാധ്യതയുള്ള ഓഫ്-ടാർഗെറ്റ് സൈറ്റുകൾ തിരിച്ചറിയുന്നതിലൂടെ, sgRNAcas9 കൂടുതൽ നിർദ്ദിഷ്ട ടാർഗെറ്റ് സൈറ്റുകൾ തിരഞ്ഞെടുക്കാൻ അനുവദിക്കുന്നു, കൂടാതെ ബോണഫൈഡ് ഓഫ്-ടാർഗെറ്റ് സൈറ്റുകൾ തിരിച്ചറിയാൻ സഹായിക്കുന്നു, ജീനോം എഡിറ്റിംഗ് ആപ്ലിക്കേഷനുകൾക്കായി sgRNA രൂപകൽപ്പന ചെയ്യുന്നത് ഗണ്യമായി സഹായിക്കുന്നു.
ഉദ്ധരണികൾ: Xie S, ShenB, Zhang C, Huang X, Zhang Y. sgRNAcas9: CRISPR sgRNA രൂപകൽപന ചെയ്യുന്നതിനും ഓഫ്-ടാർഗെറ്റ് ക്ലീവേജ് സൈറ്റുകൾ വിലയിരുത്തുന്നതിനുമുള്ള ഒരു സോഫ്റ്റ്‌വെയർ പാക്കേജ്. PLoS വൺ. 2014,9(6):e100448.
http://www.biootools.com/

ഇത് https://sourceforge.net/projects/sgrnacas9/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണ്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.