Subread എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന Linux ആപ്പാണിത്, ഇതിന്റെ ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് subread-2.0.4-Windows-x86_64.tar.gz ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
Subread with OnWorks എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് സൗജന്യമായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്‌ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് OnWorks Linux ഓൺലൈനോ Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ MACOS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ ആരംഭിക്കുക.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Linux OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, അത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
സബ്ബ്രെഡ്
Ad
വിവരണം
സബ്റെഡ് സോഫ്‌റ്റ്‌വെയർ പാക്കേജ് നെക്‌സ്റ്റ്-ജെൻ സീക്വൻസിംഗ് ഡാറ്റ പ്രോസസ്സ് ചെയ്യുന്നതിനുള്ള ഒരു ടൂൾ കിറ്റാണ്. ഇതിൽ സബ്റെഡ് അലൈനർ, സബ്‌ജങ്ക് എക്‌സോൺ-എക്‌സോൺ ജംഗ്ഷൻ ഡിറ്റക്ടർ, ഫീച്ചർ കൗണ്ട്‌സ് റീഡ് സമ്മറൈസേഷൻ പ്രോഗ്രാം എന്നിവ ഉൾപ്പെടുന്നു.
gDNA-seq, RNA-seq എന്നീ രണ്ട് റീഡുകളും വിന്യസിക്കാൻ സബ്റെഡ് അലൈനർ ഉപയോഗിക്കാം. എക്‌സോൺ-എക്‌സോൺ ജംഗ്ഷൻ കണ്ടെത്തുന്നതിനായി സബ്‌ജങ്ക് അലൈനർ രൂപകൽപ്പന ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു. RNA-seq റീഡുകളുടെ മാപ്പിംഗിനായി, സബ്റെഡ് പ്രാദേശിക വിന്യാസവും സബ്‌ജങ്ക് ആഗോള വിന്യാസവും ചെയ്യുന്നു. സബ്‌റെഡും സബ്‌ജങ്കും ഇനിപ്പറയുന്ന പേപ്പറിൽ പ്രസിദ്ധീകരിച്ചു: യാങ് ലിയാവോ, ഗോർഡൻ കെ സ്മിത്ത്, വെയ് ഷി. "ദി സബ്റെഡ് അലൈനർ: സീഡ്-ആൻഡ്-വോട്ട് വഴി വേഗതയുള്ളതും കൃത്യവും അളക്കാവുന്നതുമായ റീഡ് മാപ്പിംഗ്", ന്യൂക്ലിക് ആസിഡ് റിസർച്ച്, 2013, 41(10):e108
സവിശേഷതകൾ
- റീഡ് അലൈനർ
- അടുത്ത തലമുറയുടെ ക്രമം
പ്രേക്ഷകർ
ശാസ്ത്രം/ഗവേഷണം
ഉപയോക്തൃ ഇന്റർഫേസ്
കമാൻഡ്-ലൈൻ
പ്രോഗ്രാമിംഗ് ഭാഷ
C
Categories
ഇത് https://sourceforge.net/projects/subread/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണ്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.
