ലിനക്സിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനുള്ള ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം അസംബ്ലി ORA എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന Linux ആപ്പാണിത്, ഇതിന്റെ ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് saccharomyces_cerevisiae_3Mreads_ordered.sam.gz ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
Linux-ൽ OnWorks-ൽ സൗജന്യമായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് അസംബ്ലി ORA എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് ഓൺലൈനായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്‌ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് OnWorks Linux ഓൺലൈനോ Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ MACOS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ ആരംഭിക്കുക.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Linux OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, അത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഓൺലൈനിൽ Linux-ൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാൻ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് അസംബ്ലി ORA
വിവരണം:
റഫറൻസ് അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് പുനർനിർമ്മാണത്തിനുള്ള സോഫ്‌വെയർ. RNA-seq-ൽ നിന്ന് ലഭിച്ച ചെറിയ വായനകളിൽ നിന്ന് പുനർനിർമ്മാണം നടത്തുന്നു. ഓരോ ജീനിനും കുറഞ്ഞ എണ്ണം ഇൻട്രോണുകളുള്ള ലോവർ യൂക്കാരിയോട്ടുകളുടെ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമുകൾ കൈകാര്യം ചെയ്യാൻ ഇത് ഏറ്റവും അനുയോജ്യമാണ്, കൂടാതെ ഇത് പ്രോകാരിയോട്ടുകൾക്കും ഉപയോഗിക്കാം.ഇതിന് റഫറൻസ് ജീനോമിൽ വിന്യസിച്ചിരിക്കുന്ന റീഡുകളുള്ള ഒരു SAM ഫയലും (ഓപ്ഷണൽ) റഫറൻസ് ജീനോമിലെ ജീനുകളുടെ സ്ഥാനമുള്ള ഒരു gff ഫയലും ആവശ്യമാണ്.
ഇത് ഔട്ട്‌പുട്ടിൽ തിരിച്ചറിഞ്ഞ ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്റ്റുകളുടെ സ്ഥാനങ്ങൾ, യുടിആർ മേഖലകളുടെ വലിപ്പം, gff ഫയലിലുള്ള ജീനുകളെ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് പേരുകൾ എന്നിവ നൽകുന്നു.
പ്രേക്ഷകർ
ശാസ്ത്രം/ഗവേഷണം
ഉപയോക്തൃ ഇന്റർഫേസ്
കമാൻഡ്-ലൈൻ
പ്രോഗ്രാമിംഗ് ഭാഷ
പേൾ
ഇത് https://sourceforge.net/projects/transcriptomeassemblyora/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണ്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.