bawang putih - Dalam talian di Awan

JADUAL:

NAMA

bawang putih - program visualisasi molekul

SINOPSIS

bawang putih [benar Bawang putih pilihan] [X11 pilihan] [nama fail]

DESCRIPTION

Halaman manual ini mendokumentasikan secara ringkas bawang putih, program visualisasi molekul percuma.
Dokumentasi yang luas dalam format dan sumber HTML boleh didapati di rumah bawang putih,
<URL:http://garlic.mefos.hr/garlic/>. Lokasi fizikal: Sekolah Perubatan, Universiti
dari Osijek, Croatia, Eropah. Pakej prapenyusun untuk beberapa pengedaran GNU/Linux
boleh didapati. Ini termasuk Debian, SuSE, Mandriva, Linspire dan beberapa yang lain
distro. Dokumentasi HTML boleh dimuat turun dan dibongkar untuk kegunaan tempatan (disyorkan
penggunaan). Di sini anda boleh menemui penerangan ringkas tentang program dan senarai arahan
pilihan baris.

bawang putih ialah program visualisasi molekul yang asalnya ditulis untuk penyiasatan
protein membran. Kini ia boleh digunakan untuk menggambarkan dan menyunting mudah semua protein dan
molekul. Versi ini mengiktiraf format PDB versi 2.1; lihat fail sumber pdb_atom.c
untuk butiran tentang format ini.

PILIHAN

Pilihan baris arahan boleh dibahagikan kepada dua kumpulan: benar (khusus) bawang putih pilihan and X11
pilihan. Pilihan boleh diberikan dalam sebarang susunan. Semua pilihan dan nilai lalai berkod keras adalah
disenaraikan dalam jadual di bawah. Untuk setiap parameter, nilai yang ditakrifkan melalui baris arahan ialah
digunakan, jika ada. Jika tidak, nilai yang ditakrifkan dalam .garlicrc fail digunakan. Jika .garlicrc
fail tidak tersedia, atau tiada entri yang sepadan dalam fail ini, kod keras
nilai lalai digunakan. Sampel .garlicrc fail yang disertakan dalam pakej asal mengandungi
nilai yang sama dengan lalai berkod keras.

bawang putih pilihan yang berikut:
-h, - membantu
Cetak bantuan dan keluar.

-v, --versi
Versi cetak dan keluar.

-r, --daftar
Daftar bawang putih: maklumkan pengarang bahawa tapak anda telah memasang bawang putih dan seseorang itu
akan menggunakan program ini. Dengan mendaftar, anda menggalakkan pengarang untuk
meneruskan pembangunan bawang putih. Anda juga boleh membantu pengarang untuk memastikan sokongan untuk
perkembangan selanjutnya. Pilihan ini menghantar satu mesej e-mel pendek, mengandungi sahaja
pengepala mesej e-mel dan perkataan 'Hai!', kepada[e-mel dilindungi]>. Tolonglah
laksanakan bawang putih -r jika anda akan menggunakan program ini. Jika anda tidak disambungkan ke
Internet, pertimbangkan untuk menghantar mesej ringkas daripada beberapa sistem lain.

-nosys Sembunyikan ikon sistem koordinat (sudut kiri atas).

-tiada kawalan
Sembunyikan tetingkap kawalan (sudut kanan atas).

-stereo
Paparkan imej stereo.

-papak mod
Mod papak lalai. Mod papak yang tersedia ialah: mati, planar (lalai), sfera,
separuh sfera, silinder dan separuh silinder.

-pudar mod
Mod pudar warna lalai. Mod yang tersedia: mati, planar (lalai), sfera,
separuh sfera, silinder dan separuh silinder.

-seperti nombor
Gaya lukisan atom lalai (lalai berkod keras: 2).

-bs nombor
Gaya lukisan bon lalai (lalai berkod keras: 2).

-fs nombor
Bilangan lalai permukaan pudar warna. Satah selari, sfera sepusat atau
silinder sepusat boleh digunakan sebagai permukaan pudar. Tiga kembar tiga RGB ialah
ditetapkan pada setiap permukaan. Jarak permukaan sama rata; sekurang-kurangnya satu dan paling banyak
lapan harus ditakrifkan. Sekurang-kurangnya tiga warna (kiri, tengah dan kanan) adalah
diberikan kepada setiap atom yang kelihatan. Ketiga-tiga warna ini adalah berdasarkan kedudukan a
atom yang diberikan relatif kepada permukaan pudar yang terdekat dan pada warna yang diberikan kepada
permukaan-permukaan ini. Warna digabungkan menggunakan pemberat linear.

-lc warna
Warna kiri pada permukaan ke-i; i adalah antara sifar dan tujuh. Rentetan warna
hendaklah mematuhi X11R5. Biru, sebagai contoh, boleh ditakrifkan sebagai biru atau sebagai
RGB:0000/0000/FFFF dsb. Contohnya -lc4 RGB:BBBB/8888/4444 mentakrifkan warna kiri
pada permukaan yang indeksnya sama dengan empat.

-mc warna
Warna tengah pada permukaan ke-i.

-rc warna
Warna tepat pada permukaan ke-i.

-pc, --print-config
Cetak data konfigurasi dan keluar.

-pcn Cetak nama kursor untuk stdout dan keluar.

-log fail log
Tulis arahan dan mesej untuk log fail. Fail akan dibuat dalam semasa
direktori kerja. Jika ini tidak boleh dilakukan, fail log akan dibuat di rumah pengguna
direktori.

X11 pilihan:
-paparan nama paparan
Pelayan X untuk dihubungi.

-geometri geom
Geometri tetingkap (lalai: hampir keseluruhan skrin).

-bg warna
Warna latar belakang tetingkap utama (lalai ialah hitam).

-fg warna
Warna latar depan tetingkap utama (lalai: putih).

-fn nama fon
Fon teks; (lalai ialah 10x20).

-tbg warna
Warna latar belakang teks (lalai ialah hitam).

-tfg warna
Warna teks (lalai ialah putih).

-kursor nama kursor
Nama kursor; lihat /usr/include/X11/cursorfont.h untuk nama; keluarkan awalan XC_.

Gunakan bawang putih dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net