Ini ialah arahan gt-uniq yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
gt-uniq - Tapis keluar graf nod ciri berulang dalam fail GFF3 yang diisih.
SINOPSIS
gt unik [pilihan ...] [GFF3_file]
DESCRIPTION
-v [ya|tidak]
bertele-tele (lalai: tidak)
-o [nama fail]
ubah hala output ke fail yang ditentukan (lalai: tidak ditentukan)
-gzip [ya|tidak]
tulis fail output termampat gzip (lalai: tidak)
-bzip2 [ya|tidak]
tulis fail output termampat bzip2 (lalai: tidak)
-paksa [ya|tidak]
paksa menulis ke fail output (lalai: tidak)
-membantu
paparan bantuan dan keluar
-turun
memaparkan maklumat versi dan keluar
Traversal depth-first graf nod ciri bermula pada nod ciri peringkat atas (atau
pseudo-node) dan meneroka sejauh mungkin di sepanjang setiap cawangan sebelum menjejak ke belakang. mari
andaikan bahawa nod ciri disimpan dalam senarai mengikut susunan traversal mereka (dipanggil
"senarai nod ciri").
Dua graf nod ciri dianggap berulang jika senarai nod ciri mereka (daripada
depth-first traversal) mempunyai panjang yang sama dan setiap pasangan nod ciri (dari kedua-dua senarai di
kedudukan yang sama) adalah "serupa".
Dua nod ciri adalah "serupa", jika mereka mempunyai ID jujukan, jenis ciri, julat,
helai, dan fasa.
Untuk graf ciri berulang seperti itu, graf yang mempunyai skor yang lebih tinggi (daripada peringkat tertinggi
ciri) disimpan. Jika hanya satu daripada graf nod ciri mempunyai skor yang ditentukan, yang ini adalah
disimpan.
PELAPORAN BUANG
Laporkan pepijat kepadagt-users@genometools.org>.
Gunakan gt-uniq dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net