Ini ialah arahan kmc_tools-counters_subtract yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
kmc_tools-counters_subtract - mengira penolakan pembilang dua pangkalan data KMC
SINOPSIS
kmc_tools pembilang_tolak <output
[output_params]>
DESCRIPTION
Pangkalan data output akan mengandungi hanya k-mers yang terdapat dalam set input pertama dan
mempunyai pembilang lebih tinggi daripada k-mers yang sesuai dalam set kedua. Bagi setiap k-mer yang
pembilang adalah sama dengan perbezaan antara pembilang dalam set pertama dan pembilang masuk
set kedua.
PILIHAN
Untuk setiap input terdapat parameter tambahan:
-ci
tidak termasuk k-mers yang berlaku kurang daripada kali
-cx
tidak termasuk k-mers yang berlaku lebih daripada kali
Untuk output terdapat parameter tambahan:
-ci
tidak termasuk k-mers yang berlaku kurang daripada kali
-cx
tidak termasuk k-mers yang berlaku lebih daripada kali
-cs
nilai maksimum pembilang
CONTOH
kmc - k28 file1.fastq kmers1 tmp
kmc - k28 file2.fastq kmers2 tmp
kmc_tools counters_tolak kmers1 kmers2 kmers1_kmers2_counters_tolak
Gunakan kmc_tools-counters_subtract dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
