Ini ialah arahan kmc_tools yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
kmc_tools - operasi tambahan pada pangkalan data k-mer
SINOPSIS
kmc_tools [parameter global] [parameter operasi]
DESCRIPTION
Perintah ini dan pelbagai subkomennya melaksanakan beberapa operasi pada KMC
pangkalan data.
k-mers set operasi khususnya 2 KMC pangkalan data
bersilang
persilangan 2 set k-mers
kmers_tolak
penolakan 2 set k-mers
pembilang_tolak
penolakan pembilang bagi 2 set k-mer
kesatuan
gabungan 2 set k-mers
operasi khususnya tunggal kmc pangkalan data
jenis
menyusun k-mers daripada pangkalan data yang dijana oleh KMC2.x
mengurangkan
kecualikan k-mers yang terlalu jarang dan terlalu kerap
padat
keluarkan kaunter (simpan k-mers sahaja)
histogram
histogram kejadian k-mers
membuang
buang k-mers dan pembilang ke fail teks
lebih kompleks operasi:
kompleks
operasi kompleks dengan beberapa pangkalan data input
lain operasi:
menapis
tapis bacaan dengan bilangan k-mers yang terlalu kecil
PILIHAN
global parameter:
-t
jumlah bilangan utas (lalai: bilangan teras CPU)
-v
dayakan mod verbose (menunjukkan beberapa maklumat) (lalai: palsu)
-hp
sembunyikan kemajuan peratusan (lalai: palsu)
CONTOH
kmc_tools union db1 -ci3 db2 -ci5 -cx300 db1_union_db2 -ci10
Gunakan kmc_tools dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
