Ini ialah apl Linux bernama 123NGS yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai 123Fastq_v1.1.rar. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama 123NGS ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
123NGS
DESCRIPTION
123Fastq, sebagai ahli pertama keluarga 123NGS, melaksanakan semua pra-proses sekitar bacaan penjujukan generasi seterusnya (fail FASTQ) dengan lebih mudah berbanding sebelum ini dalam bidang alat sumber terbuka.Muat turun manual pengguna pantas:
http://bit.ly/36uoA2C
Kerja ini telah dilakukan di bawah penyeliaan
Dr.Javad Zahiri, Makmal Bioinformatik dan Omik Pengiraan (BioCOOL)
and
Dr.Masoud Garshasbi, Jabatan Genetik Perubatan, Fakulti Sains Perubatan, Universiti Tarbiat Modares, Tehran, Iran.
Ciri-ciri
- Penjujukan generasi seterusnya membaca pemeriksaan kualiti
- Semakan kualiti bacaan berpasangan akhir
- Pemangkas fleksibel
- Potong pengesyoran berdasarkan hasil semakan kualiti
- Dekontaminasi penyesuai dengan dua pendekatan
- Penukaran Fast5 kepada FASTQ
- Penukaran SAM/BAM kepada FASTQ
- Demultiplexing bacaan FASTQ
- Platform silang (unix, tingkap)
- Ditulis dalam java
Antaramuka pengguna
Java Swing
Bahasa Pengaturcaraan
Java
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/project-123ngs/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
