Ini ialah apl Linux bernama GapFiller yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai GapFiller-1.1.1.zip. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama GapFiller ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
GapFiller
Ad
DESCRIPTION
GapFiller ialah pemasang tempatan seed-and-extend untuk mengisi jurang dalam bacaan berpasangan.
Ia boleh digunakan untuk kedua-dua DNA dan RNA dan ia telah diuji pada data Illumina.
GapFiller boleh digunakan pada bila-bila masa urutan hendak dipasang bermula daripada bacaan terletak di hujungnya, dengan syarat anggaran panjang jujukan yang longgar.
Ciri-ciri
- Format input yang disokong: FASTQ (.gz, .bz2), FASTA (.gz, .bz2), SAM, BAM
- Parameter pemasangan yang sangat boleh disesuaikan
- Kemungkinan untuk menentukan set data yang berbeza untuk pembenihan dan pemasangan
- Kemungkinan untuk menyimpan maklumat susun atur (baca kedudukan dan orientasi dalam contigs yang dipasang)
Antaramuka pengguna
Barisan arahan
Bahasa Pengaturcaraan
C + +
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/gapfiller/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
