Ini ialah apl Linux bernama MethylExtract yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai MethylExtract.tgz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama MethylExtract ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
Ekstrak Metil
Ad
DESCRIPTION
MethylExtract ialah alat mesra pengguna untuk menjana i) peta metilasi genom keseluruhan berkualiti tinggi dan ii) untuk mengesan variasi jujukan dalam penyediaan sampel yang sama. Program ini dilaksanakan ke dalam satu skrip dan mengambil kira semua sumber ralat utama: ralat penjujukan, kegagalan bisulfit, bacaan klon dan varian nukleotida tunggal. MethylExtract mengesan variasi (SNVs – Variasi Nukleotida Tunggal) dengan cara yang serupa daripada VarScan, kaedah yang sangat sensitif yang digunakan secara meluas dalam panggilan SNP dan genotip berdasarkan bacaan yang dirawat bukan bisulfit.
Ciri-ciri
- Metilasi dan panggilan SNV daripada eksperimen NGS BS-Seq
- Mengesan dan mengalih keluar kemungkinan pendua PCR
- Pengesanan kegagalan bisulfit Putative
- Kawalan ralat urutan
- Penilaian kegagalan bisulfit statistik
- Pemprosesan fail SAM / BAM bisulfite
- Multithreading dan kawalan memori
Bahasa Pengaturcaraan
Perl
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/methylextract/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
