Ini ialah apl Linux bernama OpenFold yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai OpenFoldv1.0.1.zip. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama OpenFold ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
OpenFold
DESCRIPTION
OpenFold mengeluarkan semula (hampir) semua ciri kod inferens sumber terbuka asal (v2.0.1) dengan teliti. Satu-satunya pengecualian ialah penggabungjalinan model, yang bernasib buruk dalam ujian ablasi DeepMind sendiri dan sedang dihentikan secara berperingkat dalam eksperimen DeepMind akan datang. Ia ditinggalkan di sini demi mengurangkan kekacauan. Dalam kes di mana kertas Nature berbeza daripada sumber, kami sentiasa menunda kepada yang kedua. OpenFold boleh dilatih dalam ketepatan penuh, separuh ketepatan atau bfloat16 dengan atau tanpa DeepSpeed, dan kami telah melatihnya dari awal, sepadan dengan prestasi asal. Kami telah mengeluarkan berat model dan data latihan kami secara terbuka — kira-kira 400,000 fail hit templat MSA dan PDB70 — di bawah lesen permisif. Berat model tersedia melalui skrip dalam repositori ini manakala MSA dihoskan oleh Registry of Open Data on AWS (RODA).
Ciri-ciri
- Inferens yang lebih pantas pada GPU, kadangkala sebanyak 2x
- Inferens pada rantai yang sangat panjang, dimungkinkan oleh pelaksanaan perhatian memori rendah kami
- Kernel perhatian CUDA tersuai yang diubah suai daripada kernel FastFold menyokong perhatian di tempat semasa inferens dan latihan
- Skrip penjajaran yang cekap menggunakan saluran paip AlphaFold HHblits/JackHMMER asal atau ColabFold's
- Sokongan FlashAttention sangat mempercepatkan perhatian MSA
- OpenFold juga menyokong inferens menggunakan parameter rasmi AlphaFold
Bahasa Pengaturcaraan
Python
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/openfold.mirror/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
