Ini ialah aplikasi Linux bernama ParaSim yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai parasim-v0.05.zip. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian aplikasi bernama ParaSim ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
ParaSim
DESCRIPTION
Penilaian kepelbagaian dan perbandingan pangkalan data kompaun besar memerlukan pengiraan persamaan berjuta-juta kompaun dalam masa yang berpatutan. ParaSim menangani cabaran ini dengan menyelaraskan pengiraan mengikut bilangan teras pengkomputeran yang terdapat pada satu mesin. Ia dioptimumkan untuk pemprosesan bilangan struktur pertanyaan yang sangat besar terhadap bilangan struktur rujukan yang sangat besar. Sebagai ciri khas, ParaSim membenarkan untuk menyimpan dan dan mengakses set data yang kerap ditanya sebagai objek berterusan dalam ingatan untuk masa tindak balas yang singkat.
ParaSim mengira persamaan kimia berdasarkan cap jari struktur binari. Ia tidak mengira cap jari dengan sendirinya tetapi bergantung pada perisian pihak ketiga untuk berbuat demikian. Pada asasnya, semua jenis cap jari struktur yang boleh disimpan dalam tatasusunan bit (set bit) boleh digunakan oleh ParaSim.
Lihat Wiki (https://sourceforge.net/p/parasim/wiki/Documentation/) untuk dokumentasi terperinci.
MAKLUM BALAS AMAT DIHARGAI!
Ciri-ciri
- Menggunakan berbilang teras pengkomputeran
- Boleh menyimpan dan mengakses cap jari secara berterusan dalam ingatan
- Keputusan dilaporkan: ID molekul pertanyaan, ID molekul rujukan, pekali persamaan dan, secara pilihan, data tambahan seperti rentetan Smiles/InChi-Key/Chime dsb.
- Membenarkan bilangan hits yang ditentukan pengguna bagi setiap pertanyaan dan ambang persamaan
- Membenarkan saiz bitset cap jari yang berbeza
- Menyediakan maklumat kemajuan terperinci atas permintaan
- Tiada pemasangan diperlukan
- Membaca cap jari sebagai bitset berkod Base64 daripada fail .txt atau .txt.gz
- Aplikasi demo untuk RDKit, PipelinePilot(TM) dan Knime disertakan
- Skrip disertakan untuk mencari terus daripada fail SDF atau Smiles
Penonton
Pembangun, Pengguna Akhir/Desktop, Penguji, Sains/Penyelidikan
Antaramuka pengguna
Baris arahan, Konsol/Terminal
Bahasa Pengaturcaraan
C, Perl, Python
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/parasim/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
