Ini ialah apl Linux bernama SOAP3-DP yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai soap3-dp-2.3.172-cuda4.2-linux-AmazonEC2.tar.gz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama SOAP3-DP ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
SOAP3-DP
DESCRIPTION
Kod Terkini di GitHub:
https://github.com/aquaskyline/SOAP3-dp
SOAP3-dp, melalui memanfaatkan kuasa pengiraan kedua-dua CPU dan GPU dengan algoritma yang dioptimumkan, memberikan kelajuan tinggi dan kepekaan secara serentak. Berbanding dengan penjajar yang diterima pakai secara meluas termasuk penjajar BWA, Bowtie2, SeqAlto, CUSHAW2, GEM dan berasaskan GPU BarraCUDA dan CUSHAW, SOAP3-dp didapati dua hingga puluhan kali lebih pantas, sambil mengekalkan kepekaan tertinggi dan kadar penemuan palsu terendah (FDR ) pada bacaan Illumina dengan panjang yang berbeza. SOAP3-dp menyokong format fail BAM secara asli dan menyediakan skema pemarkahan yang sama seperti BWA, yang membolehkannya disepadukan ke dalam saluran paip analisis sedia ada.
Petikan: Luo R, Wong T, Zhu J, Liu CM, Zhu X, et al. (2013) SOAP3-dp: Penyelaras Bacaan Pendek Berasaskan GPU yang Pantas, Tepat dan Sensitif. PLoS ONE 8(5): e65632. doi:10.1371/journal.pone.0065632
Penonton
Sains/Penyelidikan
Antaramuka pengguna
Konsol/Terminal
Bahasa Pengaturcaraan
C++, C
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/soap3dp/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
