Dit is de opdrachtspier die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
spier - Uitlijning van meerdere eiwitsequenties
KORTE INHOUD
spier -in invoer filet (snel) [-uit uitvoer filet (standaard snel)] [-diagnoses] [-logboek inloggen filet]
[- maxiters n] [-maxuren n] [-maxmb m] [-html] [-msf] [-clw] [- streng]
[-log[een] logfile] [-rustig] [-stal] [-groep] [-versie]
PRODUCTBESCHRIJVING
Deze handleiding documenteert in het kort de: spier opdracht.
spier lijnt eiwitsequenties uit en wordt als superieur en sneller beschouwd dan Clustal W.
OPTIES
-in invoer filet
Pad naar FASTA-geformatteerd invoerbestand
-uit uitvoer filet
Pad naar uitvoerbestand, standaard FASTA geformatteerd
-diagnoses
Vind diagonalen (sneller voor vergelijkbare reeksen)
- maxiters n
Maximaal aantal iteraties (geheel getal, standaard 16)
-maxuren n
Maximale iteratietijd in uren (standaard geen limiet)
-maxmb m
Maximaal toe te wijzen geheugen in Mb (standaard 80% van RAM)
-html
Uitvoer schrijven in HTML-formaat (standaard FASTA)
-msf
Schrijfuitvoer in MSF-formaat (standaard FASTA)
-clw
Schrijfuitvoer in Clustal W-formaat (standaard FASTA)
- streng
Als -clw, met ´CLUSTAL W (1.81)´ header
-log[een] logfile
Loggen naar bestand (toevoegen als -loga, overschrijven als -log)
-rustig
Schrijf geen voortgangsberichten naar stderr
-stal
Uitvoerreeksen in invoervolgorde (standaard is -groep)
-groep
Groepeer reeksen op gelijkenis (dit is de standaard)
-versie
Versie-informatie weergeven en afsluiten
Gebruik spierkracht online met behulp van onworks.net-services
