Dit is de opdracht pyFAI-calib die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
pyFAI-calib - kalibratietool
PRODUCTBESCHRIJVING
gebruik: pyFAI-calib [opties] -w 1 -D detector -c calibrant.D afbeeldingsbestand.edf
Kalibreer de geometrie van de diffractie-instelling op basis van afbeeldingen van Debye-Sherrer-ringen zonder een
voorafgaande kennis van uw opstelling. U moet een kalibrant- of een "d-spacing"-bestand aanleveren
met de afstand van Miller-plannen in Angstrom (in afnemende volgorde). Kalibratiemiddelen
verkrijgbaar: Ni, CrOx, NaCl, Si_SRM640e, Si_SRM640d, Si_SRM640a, Si_SRM640c, Si_SRM640b,
Cr2O3, AgBh, Si_SRM640, CuO, PBBA, alpha_Al2O3, kwarts, C14H30O, cristobaltiet, Si, LaB6,
CeO2, LaB6_SRM660a, LaB6_SRM660b, LaB6_SRM660c, TiO2, ZnO, Al, Au of zoek in de
Amerikaanse Mineralogist-database: http://rruff.geo.arizona.edu/AMS/amcsd.php De --kalibrant
optie is verplicht!
positie- argumenten:
BESTAND Lijst met te kalibreren bestanden
optioneel argumenten:
-h, --help
toon dit helpbericht en sluit af
-V, --versie
toon het versienummer van het programma en sluit af
-o HET DOSSIER, --uit FILE
Bestandsnaam waar de verwerkte afbeelding wordt opgeslagen
-v, --uitgebreid
overschakelen naar debug/verbose-modus
-c HET DOSSIER, --kalibrant FILE
Kalibrantnaam of bestand met de d-afstand van het referentiemonster (VERPLICHT,
hoofdlettergevoelig !)
-w GOLFLENGTE, --golflengte GOLFLENGTE
golflengte van de röntgenbundel in Angstrom. Verplicht
-e ENERGIE, --energie ENERGIE
energie van de röntgenbundel in keV (hc=12.398419292keV.A).
-P POLARIZATIE_FACTOR, --polarisatie POLARIZATIE_FACTOR
polarisatiefactor, van -1 (verticaal) tot +1 (horizontaal), standaard is Geen (nr
correctie), synchrotrons liggen rond de 0.95
-i HET DOSSIER, --ponie FILE
bestand met de diffractieparameter (poni-bestand). VERPLICHT voor
pyFAI-recalib!
-b ACHTERGROND, --achtergrond ACHTERGROND
Automatische achtergrondaftrekking als er geen waarde wordt opgegeven
-d DONKER, --donker DARK
lijst met door komma's gescheiden donkere afbeeldingen om te gemiddelde en af te trekken
-f VLAK, --vlak FLAT
lijst met door komma's gescheiden platte afbeeldingen om te middelen en te delen
-s SPLINE, --splijn SPLINE
spline-bestand dat de vervorming van de detector beschrijft
-D DETECTOR_NAME, --detector DETECTOR_NAME
Detectornaam (in plaats van pixelgrootte+spline)
-m MASKER, --masker MASK
bestand met het masker (voor beeldreconstructie)
-n NPT, --pt NPT
bestand met opgeslagen datapunten. Standaard: basisnaam.npt
--filter FILTER
selecteer het filter, gemiddelde (standaard), max of mediaan
-l AFSTAND, --afstand AFSTAND
monster-detectorafstand in millimeter. Standaard: 100 mm
--afst AFSTAND
monster-detectorafstand in meter. Standaard: 0.1 m
--poni1 PONI1
poni1-coördinaat in meter. Standaard: midden van detector
--poni2 PONI2
poni2-coördinaat in meter. Standaard: midden van detector
--rot1 ROT1
rot1 in radialen. standaard: 0
--rot2 ROT2
rot2 in radialen. standaard: 0
--rot3 ROT3
rot3 in radialen. standaard: 0
--fix-afst
bevestig de afstandsparameter
--vrije-dist
bevrijd de afstandsparameter. Standaard: Geactiveerd
--fix-poni1
repareer de parameter poni1
--gratis-poni1
bevrijd de poni1-parameter. Standaard: Geactiveerd
--fix-poni2
repareer de parameter poni2
--gratis-poni2
bevrijd de poni2-parameter. Standaard: Geactiveerd
--fix-rot1
repareer de rot1-parameter
--vrij-rot1
bevrijd de rot1-parameter. Standaard: Geactiveerd
--fix-rot2
repareer de rot2-parameter
--vrij-rot2
bevrijd de rot2-parameter. Standaard: Geactiveerd
--fix-rot3
repareer de rot3-parameter
--vrij-rot3
bevrijd de rot3-parameter. Standaard: Geactiveerd
--fix-golflengte
bevestig de golflengteparameter. Standaard: Geactiveerd
--vrije golflengte
bevrijd de golflengteparameter. Standaard: Gedeactiveerd
--kantelen Laat aanvankelijk de detectorkanteling verfijnen (rot1, rot2, rot3). Standaard: geactiveerd
--geen kanteling
Kantelverfijning gedeactiveerd en alle rotatie op 0 gezet
--verzadiging VERZADIGING
beschouw alle pixels>max*(1-verzadiging) als verzadigd en reconstrueer ze, standaard: 0
(gedeactiveerd)
--gewogen
gewicht passend op intensiteit, standaard niet.
--npt NPT_1D
Aantal punten in 1D geïntegreerd patroon, standaard: 1024
--npt-azim NPT_2D_AZIM
Aantal azimutale sectoren in geïntegreerde 2D-beelden. Standaard: 360
--npt-rad NPT_2D_RAD
Aantal radiale bakken in geïntegreerde 2D-afbeeldingen. Standaard: 400
--eenheid EENHEID
Geldige eenheden voor radiaal bereik: 2th_deg, 2th_rad, q_nm^-1, q_A^-1, r_mm. Standaard:
2e_graden
--geen-gui
forceer het programma om te werken zonder een grafische interface
--niet-interactief
het programma forceren om uit te voeren en af te sluiten zonder om verfijningen te vragen
-r, --reconstrueren
Reconstrueer een afbeelding waarbij gegevens worden gemaskeerd of <0 (voor Pilatus-detectoren of detectoren
met modules)
-g GAUSSIAANS, --gaussiaans GAUSSIAANS
Grootte van de Gaussische kernel. Grootte van de opening (in pixels) tussen twee opeenvolgende
ringen, standaard 100 Verhoog de waarde als de boog niet compleet is; verminder de
waarde als bogen met elkaar worden gemengd.
--vierkant
Gebruik de vierkante kernelvorm voor het zoeken naar buren in plaats van de ruitvorm
-p PIXEL, --pixel PIXEL
grootte van de pixel in micron
De uitvoer van dit programma is een "PONI"-bestand met de detectorbeschrijving en de 6
verfijnde parameters (afstand, centrum, rotatie) en golflengte. Een 1D- en 2D-diffractie
Er worden ook patronen geproduceerd. (.dat- en .azim-bestanden)
Gebruik pyFAI-calib online met behulp van onworks.net-services