Dit is de Linux-app met de naam BIGSdb waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als bigsdb_1.24.1.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam BIGSdb gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
BIGSdb
PRODUCTBESCHRIJVING
De Bacterial Isolate Genome Sequence Database (BIGSdb) is een schaalbaar, via het web toegankelijk databasesysteem dat is ontworpen om gekoppelde fenotypische en genotypische informatie op een rekenkundig efficiënte manier op te slaan en te analyseren. Sequentiegegevens kunnen variëren van enkele sequentielezingen tot meerdere contigs die zijn gegenereerd door sequentietechnologieën voor het hele genoom. Het systeem bevat de capaciteit om elk aantal loci en genetische varianten op die loci binnen de opgeslagen nucleotidesequenties te definiëren en te identificeren. Deze loci kunnen verder worden georganiseerd in schema's voor geïsoleerde karakterisering of voor evolutionaire of functionele analyses.Zie Jolley en Maiden 2010, BMC Bioinformatics 11:595 (http://www.biomedcentral.com/1471-2105/11/595).
U kunt bugs melden of verbeteringsverzoeken indienen met behulp van de issue-tracker op https://github.com/kjolley/BIGSdb. De broncode wordt daar ook gespiegeld.
Toehoorders
Wetenschap/onderzoek, geavanceerde eindgebruikers, ontwikkelaars
Gebruikersinterface
Web-based
Programmeertaal
Perl, Javascript
Database-omgeving
PostgreSQL (pgsql)
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/bigsdb/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
