Dit is de Linux-app genaamd CBMPy om online in Linux te draaien, waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als cbmpy-0.7.25.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam CBMPy online uit om gratis online in Linux te draaien met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
CBMPy om online onder Linux te draaien
PRODUCTBESCHRIJVING
PySCeS CBMPy is een nieuw platform voor op beperkingen gebaseerde modellering en analyse. Het is ontworpen met behulp van principes die zijn ontwikkeld in het PySCeS-simulatiesoftwareproject: bruikbaarheid, flexibiliteit en toegankelijkheid.CBMPy ondersteunt de nieuwste standaarden voor het coderen van CBM-modellen, SBML L3 FBC, COBRA en MIRIAM-compatibele RDF en aangepaste annotaties.
De architectuur is zowel uitbreidbaar als flexibel en maakt gebruik van datastructuren die intuïtief zijn voor de bioloog, terwijl deze op transparante wijze worden vertaald naar de onderliggende wiskundige structuren.
.
CBMPy implementeert populaire analyses zoals FBA, FVA, element-/ladingbalancering, netwerkanalyse en modelbewerking, evenals geavanceerde methoden die zijn ontwikkeld voor de ecosysteemmodellering.
CBMPy ondersteunt gebruikersinteractie via:
- interactieve console of als bibliotheek voor geavanceerd gebruik
- GUI, visuele weergave van het model, analysemethoden
- een op SOAP gebaseerde webAPI maakt functionaliteit op hoog niveau mogelijk via webservices
Kenmerken
- ondersteuning voor modelleringsstandaarden: SBML, SED-ML, SBML3FBC, OMEX (archief combineren)
- ondersteunt MIRIAM-compatibele annotatie als RDF, evenals aangepaste sleutelwaardegegevens
- meerdere gebruikersinterfaces, GUI CLI, NOUI
- flexibele, open architectuur
Toehoorders
Wetenschap/onderzoek, onderwijs, geavanceerde eindgebruikers, eindgebruikers/desktop
Gebruikersinterface
Console/Terminal, wxWidgets
Programmeertaal
Python
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/cbmpy/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
