Dit is de Linux-app genaamd COPEread waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als copie-v1.2.5.tgz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app genaamd COPEread gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
COPElees
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
COPE (Connecting Overlapped Pair-End reads) is een methode voor het uitlijnen en verbinden van de door Illumina gesequenced Pair-End-reads waarvan de invoeggrootte kleiner is dan de som van de twee leeslengtes. De verbonden reads kunnen worden gebruikt bij de assemblage van het genoom, waarbij de sequentie opnieuw wordt bepaald en transcriptoomonderzoek.
Het volledige citaat:
COPE: Een nauwkeurig, op k-mer gebaseerd pair-end-reading-verbindingshulpmiddel om de assemblage van het genoom te vergemakkelijken
Binghang Liu; Jianying-yuan; Siu-Ming Yiu; Zhenyu Li; Yinlong Xie; Yanxiang Chen; Yujian Shi; Hao Zhang; Yingrui Li; Tak-Wah Lam; Ruibang Luo
Bio-informatica (2012) 28(22): 2870-2874; doi: 10.1093/bioinformatica/bts563
Kenmerken
- sluit overlappend paar-uiteinde lezen
Programmeertaal
C + +
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/coperead/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
