Dit is de Linux-app genaamd denovo_solid_pipeline waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als denovo_solid_pipeline_1.0.1.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam denovo_solid_pipeline gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
denovo_solid_pipeline
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
denovo_solid_pipeline (DSP) is een semi-geautomatiseerde pijplijn voor korte genoomassemblage met behulp van SOLiD-sequencinggegevens. De belangrijkste kenmerken van de pijplijn zijn de optimalisatie van het aantal leescorrectieruns en rekenbronnen via dynamisch programmeren. DSP heeft ook het voordeel ten opzichte van de momenteel beschikbare pijplijn (denovo2) dat het meer contigs genereert die geschikt zijn voor verdere assemblagestappen, waardoor de kans op het detecteren van sequentiefouten en/of polymorfe locaties wordt vergroot.
Toehoorders
Science / Research
Gebruikersinterface
Console/terminal
Programmeertaal
Unix-shell
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/denovosolid/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
