Dit is de Linux-app genaamd mCarts waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als mCarts.v1.2.0.tgz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam mCarts gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
mCarts
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
Veel RBP's herkennen zeer korte en gedegenereerde sequenties, met gerichte specificiteit die wordt bereikt door mechanismen zoals synergetische binding aan meerdere geclusterde sites en modulatie van de toegankelijkheid van sites door verschillende RNA-secundaire structuren. mCarts integreert het aantal en de tussenruimte van individuele motiefsites, hun toegankelijkheid en behoud, wat de signaal-ruisverhouding aanzienlijk verbetert. Dit algoritme leert en kwantificeert de regels van deze kenmerken, gebruikmakend van een groot aantal in vivo RBP-bindingsplaatsen die zijn verkregen door sequentiëring met hoge doorvoer van RNA's die zijn geïsoleerd door verknoping en immunoprecipitatie (HITS-CLIP). We hebben dit algoritme toegepast om twee representatieve RBP's, Nova en Mbnl, te bestuderen. Ondanks de zeer lage informatie-inhoud in individuele motiefelementen, deed ons algoritme zeer specifieke voorspellingen voor succesvolle experimentele validatie.
Toehoorders
Wetenschap/onderzoek, geavanceerde eindgebruikers
Gebruikersinterface
Opdrachtregel
Programmeertaal
Perl
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/mcarts/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
