Dit is de Linux-app genaamd MPICorMat waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als MPICorMat_v3.0.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam MPICorMat gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
MPICorMat
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
MPICorMat is een parallel hulpmiddel om correlatiegelijkenismatrices te construeren als onderdeel van de procedure om gen-co-expressienetwerken te genereren. Deze tool neemt als invoer een matrix met de expressiewaarden (een float-waarde) voor verschillende genen waargenomen uit verschillende monsters. Het is een parallellisatie van de eerste module van de RMTGenNet-tool (https://github.com/spficklin/RMTGeneNet). RMTGeneNet-gebruikers kunnen deze CCM-module vervangen door MPICorMat, profiteren van de snelle berekening om de gelijkenis te genereren
matrix en gebruik vervolgens de gelijkenismatrix als invoer voor de tweede module (RMM).
construeer het uiteindelijke gen-co-expressienetwerk.
Toehoorders
Informatietechnologie, Gezondheidszorg, Wetenschap/Onderzoek
Gebruikersinterface
Console/Terminal, Opdrachtregel
Programmeertaal
C + +
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/mpicormat/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
