Dit is de Linux-app genaamd PB-sQF_BacterialTyping waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als PBsQF_Mac.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam PB-sQF_BacterialTyping gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
PB-sQF_BacterialTyping
PRODUCTBESCHRIJVING
Waarschijnlijkheidsbinning - kenmerkende kwadratische vorm, PB-sQF, typt een onbekende sequentie in een van de 628 genomen van de bacteriële bibliotheek, wat de kleinste teststatistieken oplevert en dus de meest vergelijkbare bibliotheekstam.
Het invoerbestand bestaat uit de k-mer-tellingen van de onbekende samengestelde genoomsequentie of het onbewerkte korte leesbestand in decimaal formaat gegenereerd door KAnalyze, ontwikkeld door P. Audano et al. (https://sourceforge.net/projects/kanalyze/).
De download bevatte de bibliotheekindex, de bibliotheeknaam en voorbeeldonbekenden.
Kenmerken
- Teststatistieken berekenen tussen bibliotheek en onbekende k-mer-frequentie
- Typering van bacteriële sequenties
- Windows
- Mac
Programmeertaal
MATLAB
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/pb-sqf-bacterialtyping/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
