Dit is de Linux-app genaamd RNAseq-DEG-MethodLimit waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als Analysis.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam RNAseq-DEG-MethodLimit gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
RNAseq-DEG-MethodLimit
BESCHRIJVING:
Dit is niet echt een "definitieve" dataset.
Hoewel de analyse een secundaire prioriteit moet zijn voor andere verantwoordelijkheden, kan deze dataset ten minste twee doelen dienen:
1) Zorg voor een experimenteel notitieboekje/logboek voor een lopend experiment
2) Geef na toevoeging van enkele verwerkte datasets een tussentijdse bronvermelding
In de tussentijd is de beste vermelding om te gebruiken waarschijnlijk de GitHub-erkenningen:
https://github.com/cwarden45/RNAseq_templates/blob/master/TopHat_Workflow/README.md
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/rnaseq-deg-methodlimit/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.