Dit is de Linux-app genaamd skewer waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als benchmark1-arabidopsis.thaliana-scripts.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam Spies gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
vleespen
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
Dit programma implementeert een nieuw dynamisch programmeeralgoritme dat zich toelegt op het trimmen van adapters en is speciaal ontworpen voor het verwerken van Illumina-reeksen met gepaarde uiteinden.
Kenmerken
- Detectie en verwijdering van adaptersequenties
- Invoegen en verwijderen toegestaan bij patroonmatching
- Gericht op Single End, Paired End (PE) en Long Mate Pair (LMP) lezingen
- Demultiplexing van sequencing-runs met streepjescode
- Ondersteuning voor meerdere threads
- Bijsnijden op basis van phred-kwaliteitsscores
- IUPAC-tekens voor barcodes en adapters
- Gecomprimeerde invoer- en uitvoerondersteuning
Toehoorders
Science / Research
Programmeertaal
C + +
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/skewer/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
