Dit is de Linux-app genaamd TVscript waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als tvscript.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en gebruik deze app genaamd TVscript met OnWorks gratis online.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
tv-script
PRODUCTBESCHRIJVING
TVscript is een hulpmiddel dat is ontworpen om de gebruiker in staat te stellen de verwijdering van transcripten te onderzoeken die zijn gekoppeld aan variaties in het aantal leesaantallen binnen een conditie die groter zijn dan een door de gebruiker gespecificeerde drempel. Er wordt een set bijgewerkte telbestanden gemaakt van de oorspronkelijke invoergegevens waarin dergelijke transcripties ontbreken. Deze bijgewerkte telbestanden kunnen vervolgens worden gebruikt binnen downstream-analyse, bijvoorbeeld bij de identificatie van differentieel tot expressie gebrachte transcripten. In het laatste geval beïnvloedt de mate van variatie binnen de conditie de definitieve lijsten van geïdentificeerde genen dubbelzinnig en inconsistent in verschillende software die voor deze taak is ontworpen. In staat zijn om de effecten van het verwijderen van dergelijke variatie bij verschillende drempels te onderzoeken, vergroot het intuïtieve inzicht met betrekking tot zowel differentiële expressieanalyse als andere onderzoeksgebieden die dergelijke gegevens gebruiken. Volledige details en twee casestudies met transcriptomische gegevens die verband houden met de domesticatie van honden, zijn beschikbaar in onze paper: link binnenkort beschikbaar.
Kenmerken
- Verkenning van de effecten van variatie binnen de conditie in RNA-seq datasets
- Compleet testgegevensvoorbeeld in downloadmap
- Uitvoerbaar jar-bestand, draait op elk platform
- Eenvoudig te installeren, gewoon de map uitpakken
Toehoorders
Science / Research
Gebruikersinterface
Console/terminal
Programmeertaal
Java
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/tvscript/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
