Dit is de Linux-app genaamd VIGOR3 waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als VIGOR3.tgz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam VIGOR3 gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
KRACHT3
PRODUCTBESCHRIJVING
VIGOR is een hulpmiddel voor het annoteren van coderende genen in virale genomen. Het is ontwikkeld door Jeffrey Hoover en Shiliang Wang voor het JCVI Genomic Sequencing Center for Infectious Diseases (GSCID).
http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1471-2105-11-451.pdf
contact opnemen met:
Jef Hoover
301-540-7858
[e-mail beveiligd]
Kenmerken
- begrijpt RNA-bewerking, ribosomale slippage, stopcodon read-thru en alternatieve startcodons
- annoteert rijpe peptiden op polyproteïnen
- behandelt gesplitste, overlappende en ingebedde genen
- behandelt cirkelvormige, gedeeltelijke en concept (gapped) genomen
- diagnosticeert frameshifts in montage
- bevat referentiedatasets voor meer dan 50 soorten
- bevat tools voor het maken van nieuwe referentiedatasets
Toehoorders
Science / Research
Gebruikersinterface
Opdrachtregel
Programmeertaal
Perl
Database-omgeving
SQLite
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/vigor3/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
