Dit is de Windows-app genaamd NOFI ranking die in Windows online via Linux online moet worden uitgevoerd, waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als NOFI-ranking_v1.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam NOFI ranking online uit om gratis in Windows online via Linux online met OnWorks te draaien.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
NOFI-ranglijst voor gebruik in Windows online via Linux online
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
Het NOFI-rangschikkingsalgoritme is ontwikkeld om een lage prioriteit toe te kennen aan fragmentionen die worden beïnvloed door interferentie. De implementatie is een R-script dat kan worden aangepast. Een toekomstige versie zal een modulaire versie bevatten. De opzet is als volgt:1) De invoer bevat de lijst met SWATH-fragmention-XIC's van de geïdentificeerde en gekwantificeerde peptiden door softwaretools zoals Skyline en OpenSWATH.
2) De eerste stap in NOFI is de berekening van de 4 attributen (RTd, FWHMd, IRd en IRrep) die worden gebruikt om elk fragmention als een vector weer te geven.
3) Multivariate uitbijterdetectietechnieken worden gebruikt om alle fragmentionen van elk peptide te rangschikken.
4) Er worden verschillende figuren gegenereerd (een pdf-bestand) om het effect van de Top-N-fragmentionen over verschillende indicatoren te visualiseren.
5) De gebruiker kan het aantal topfragmentionen per peptide kiezen, daarbij gebruik makend van de optimale subset van Top-N NOFI's met hoge prioriteit voor kwantificering, terwijl de aangetaste fragmentionen worden uitgesloten.
Toehoorders
Science / Research
Programmeertaal
S / R
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/nofiranking/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.
