Dit is de Windows-app met de naam PBSuite die in Windows online via Linux online kan worden uitgevoerd, waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als PBSuite_15.8.24.tgz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam PBSuite online uit om gratis in Windows online via Linux online met OnWorks te draaien.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start een OS OnWorks online emulator vanaf deze website, maar een betere Windows online emulator.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Windows-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie en installeer deze.
- 7. Download Wine van de softwarebronnen voor Linux-distributies. Eenmaal geïnstalleerd, kunt u vervolgens dubbelklikken op de app om ze met Wine uit te voeren. Je kunt ook PlayOnLinux proberen, een mooie interface via Wine waarmee je populaire Windows-programma's en -games kunt installeren.
Wine is een manier om Windows-software op Linux uit te voeren, maar zonder dat Windows vereist is. Wine is een open-source Windows-compatibiliteitslaag die Windows-programma's rechtstreeks op elke Linux-desktop kan uitvoeren. In wezen probeert Wine genoeg van Windows opnieuw te implementeren, zodat het al die Windows-applicaties kan draaien zonder Windows echt nodig te hebben.
SCREENSHOTS
Ad
PBSuite om in Windows online via Linux online te draaien
PRODUCTBESCHRIJVING
Hier bevinden zich momenteel twee projecten die zijn gemaakt en onderhouden door Adam English.PBJelly - de tool voor het upgraden van het genoom.
PBHoney - de tool voor het ontdekken van structurele variaties
Beide zijn opgenomen in de PBSuite-code die te vinden is in downloads.
----- PBJelly -----
De krant lezen
http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0047768
PBJelly is een sterk geautomatiseerde pijplijn die lange sequencing-lezingen (zoals PacBio RS-lezingen of lange 454-lezingen in fasta-formaat) uitlijnt met zeer betrouwbare conceptassemblages. PBJelly vult of verkleint zoveel mogelijk gevangen hiaten om geüpgradede conceptgenomen te produceren.
----- PBHoning -----
De krant lezen
http://www.biomedcentral.com/1471-2105/15/180/abstract
PBHoney is een implementatie van twee benaderingen voor variantidentificatie die zijn ontworpen om de hoge mappability van lange leesbewerkingen (dwz meer dan 10,000 bp) te benutten. PBHoney houdt rekening met zowel intra-read discordance als soft-clipped tails van long reads om structurele varianten te identificeren.
Kenmerken
- Genoomassemblage
- Genoom-upgrade
- Structurele variatie
- Assemblage Evaluatie
Toehoorders
Science / Research
Programmeertaal
Python
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/pb-jelly/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
