Jest to polecenie bp_oligo_countp, które można uruchomić w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks przy użyciu jednej z wielu naszych bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
bp_oligo_count - liczba i częstotliwość oligo
STRESZCZENIE
Użycie: bp_oligo_count [-h/--help] [-l/--length OLIGODŁUGOŚĆ]
[-f/--format SEQFORMAT] [-i/--in/-s/--sekwencja PLIK SEKW.]
[-o/--out PLIK WYJŚCIOWY]
OPIS
Ten skrypt zlicza występowanie i częstotliwość dla wszystkich oligonukleotydów o danej długości.
Można go użyć do określenia, które startery są przydatne do częstego primingu kwasu nukleinowego
do losowego etykietowania.
Zauważ, że ten skrypt można uruchomić za pomocą programu compseq, który jest częścią
WYRYĆ.
OPCJE
Domyślnym formatem sekwencji jest fasta. Jeśli nie podano pliku wyjściowego, wyniki zostaną wydrukowane
do standardu. Wszystkie inne opcje można wprowadzić interaktywnie.
INFORMACJE ZWROTNE
Mailing wykazy
Informacje zwrotne od użytkowników są integralną częścią ewolucji tego i innych modułów Bioperl. Wysłać
swoje uwagi i sugestie najlepiej na listę mailingową Bioperl. Twój udział
jest bardzo doceniane.
[email chroniony] - Ogólna dyskusja
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - O listach mailingowych
Raportowanie Błędy
Zgłaszaj błędy do systemu śledzenia błędów Bioperl, aby pomóc nam śledzić błędy i ich
Rezolucja. Zgłoszenia błędów można przesyłać przez Internet:
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
AUTOR - Charles C. Kim
E-mail [email chroniony]
HISTORIA
Napisane 2 lipca 2001 r
Zgłoszony do projektu skryptów bioperl 2001/08/06
>> 100-krotna optymalizacja prędkości autorstwa Heikki Lehvaslaiho
Korzystaj z bp_oligo_countp online, korzystając z usług onworks.net
