Jest to polecenie createChemistryHeader, które można uruchomić w darmowym dostawcy usług hostingowych OnWorks przy użyciu jednej z wielu naszych bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
createChemistryHeader.py — Utwórz nagłówek SAM z chemią sekwencjonowania PacBio
Informacja
OPIS
użycie: getChemistryHeader.py [-h] [--debug] --bas_pliki BAS_FILES
[PLIKI_BAS...]
input_alignment_file wyjściowy_nagłówek_plik
createChemistryHeader tworzy nagłówek SAM, który zawiera informacje chemiczne używane przez
Kołczan.
pozycyjny argumenty:
plik_wejściowy_wyrównania
Plik SAM lub BAM wyprodukowany przez BLASR.
plik_nagłówka_wyjściowego
Nazwa pliku nagłówkowego SAM lub BAM, który zostanie utworzony z informacjami chemicznymi
załadowany.
fakultatywny argumenty:
-h, --help
pokaż tę wiadomość pomocy i wyjdź
--odpluskwić
Wyprowadź szczegółowe informacje dziennika. (domyślnie: Fałsz)
--bas_pliki PLIKI_BASOWE [PLIKI_BAS...]
Pliki bas lub bax zawierające odczyty, które zostały wyrównane w
input_alignment_file. Może to być również plik plików bas lub bax. (domyślnie: brak)
Użyj createChemistryHeader online, korzystając z usług onworks.net