Jest to polecenie fastaq-to_tiling_bam, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
fastaq_to_tiling_bam — Utwórz plik BAM z odczytami równomiernie rozłożonymi na wejściu
odniesienie
OPIS
użycie: fastaq_to_tiling_bam [opcje]
Pobiera plik sekwencji. Tworzy plik BAM zawierający doskonałe (niesparowane) odczyty układające się w
cały genom
pozycyjny argumenty:
infile Nazwa wejściowego pliku fasta/q
długość_czytania
Długość odczytów
odczyt_kroku
Odległość pomiędzy początkiem każdego odczytu
odczyt_przedrostka
Przedrostek czytanych nazw
plik wyjściowy
Nazwa wyjściowego pliku BAM
fakultatywny argumenty:
-h, --help
pokaż tę wiadomość pomocy i wyjdź
--qual_char QUAL_CHAR
Znak używany w Wyniku Jakości [I]
--grupa_czytania CZYTAJ_GRUPĘ
Dodaj podany identyfikator grupy odczytów do wszystkich odczytów [42]
Ważne: zakłada się, że samtools jest na Twojej drodze
Korzystaj z fastaq-to_tiling_bam online, korzystając z usług onworks.net
