Jest to polecenie fastq-join, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
fastq-join - ea-utils: połącz dwa odczyty sparowanych końców na nakładających się końcach
STRESZCZENIE
szybkie dołączenie [Opcje] [kolego.fq] -o
OPIS
fastq-join: nieprawidłowa opcja -- 'h' Nieznana opcja `-h'.
Łączy dwa sparowane odczyty końców na nakładających się końcach.
OPCJE
-o FIL Zobacz „Wyjście” poniżej -v C Sprawdza, czy identyfikatory sondujące 2 pliki są zgodne
char C
użyj „” (spacji) do odczytów Illuminy
-p N N-procentowa maksymalna różnica (8) -m N N-minimalne zachodzenie (6) -r FIL
Szczegółowy raport długości ściegu -R Brak odwrotnego dopełnienia -x Zezwalaj na wstawianie
przeczytaj długość
Wyjście:
Możesz podać 3 -o argumenty dla un1, un2, łączenia plików lub jednego
argument jako szablon nazwy pliku. Do pliku dołączany jest przyrostek „un1, un2 lub Join”,
lub zastępują znak %, jeśli jest obecny.
Jeśli obecny jest plik wejściowy „mate” (odczyt kodu kreskowego), wówczas plik files
Tworzone są także „un3” i „join2”.
Skorzystaj z usługi fastq-join online, korzystając z usług onworks.net
