Jest to polecenie mbfa-mpi, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
mbfa - konwerter formatu Murasaki Binary FASTA
STRESZCZENIE
mbfa [opcje...] [wejście] [wejście2 ...] #konwertuj [wejście] i [wejście2 ...] do plików Muraaski Binary FASTA
OPIS
Murasaki przetwarza dane sekwencji przy użyciu formatu 2-bitowego, w którym każda zasada jest reprezentowana przy użyciu
2 bity. Istnieje wiele wcześniej istniejących formatów, które robią podobne rzeczy, jednak w
szczególnie Murasaki musi wiedzieć o metadanych, których nie można wyrazić w zaledwie 2
bity (np. gdzie są sekwencje NNNN, sekwencje łamią się, gdy jest wiele sekwencji
zawarte w pliku FASTA itp.), dlatego format MBFA zawiera również te dane.
Zwykle te pliki są generowane automatycznie przez Murasaki przy pierwszym uruchomieniu nowego
sekwencja.
Ponieważ format pliku został zaprojektowany ściśle z Murasaki, faktycznym rozszerzeniem pliku
będą się różnić, aby odzwierciedlić twoją architekturę. Ogólnie będzie to jakaś forma .mbfa [48] [48]
(np. ".mbfa88" (domyślna kompilacja gcc na amd64)).
OPCJE
--informacje|-i
Pokaż metadane dotyczące każdego określonego MBFA.
--siła|-f
Domyślnie mbfa pominie pliki, które mają już najnowsze pliki .mbfa. Ta opcja
wymusza regenerację tych plików.
--fatalny|-F
Sprawia, że błędy są śmiertelne. Zwykle, jeśli określisz wiele plików, mbfa spróbuje przekonwertować
wszystkie z nich, nawet jeśli jeden z nich nie wyemituje ostrzeżenia. Z --fatal zatrzyma się i zakończy działanie
z błędem, jeśli jest problem.
--fasta|-A
Generuje dane wyjściowe FASTA odpowiadające na podstawie danych MBFA na standardowe wyjście.
--help|-h, --version|-V, --verbose|-V
Czego byś się spodziewał.
Użyj mbfa-mpi online, korzystając z usług onworks.net
