mia-3ddistance-stats - Online w chmurze

PROGRAM:

IMIĘ

mia-3ddistance-stats - Oceń statystyki odległości dla dwóch oznaczonych obrazów.

STRESZCZENIE

mia-3dodległość-statystyki -i -r -o [opcje]

OPIS

mia-3dodległość-statystyki Program ten służy do oceny odległości pomiędzy jednakowymi
oznaczone obszary na dwóch obrazach. Plik wyjściowy to plik csv zawierający odległości dla
każdą oznaczoną współrzędną na obrazie testowym w następującej formie:

etykieta,n-próbek,odległość,odległość,...

Wyglądałby prosty program R do uzyskiwania statystyk dla każdej etykiety z tych danych

argumenty <- polecenieArgs(TRUE)
dane <- odczyt.csv(args[1], nagłówek=FAŁSZ)
for ( i in 1:dim(dane)[1] ) {
linia <- dane [i,]
etykieta <- as.integer(wiersz[1])
zakres_końcowy <- 2 + as.numeric(linia[2])
s <- as.numeric(line[3:end_range])
wynik <- sprintf("%d%8.4f%8.4f%8.4f%8.4f0
etykieta, średnia(e), sqrt(var(s)), mediana(s), max(s))
kot (wynik)
}

OPCJE

Plik-IO
-i --in-labels=(dane wejściowe, wymagane); ja
input label image Dla obsługiwanych typów plików zobacz PLUGINS:3dimage/io

-r --ref-labels=(dane wejściowe, wymagane); ja
referencyjny obraz etykiety Aby uzyskać informacje o obsługiwanych typach plików, zobacz PLUGINS:3dimage/io

-l --label-map=(wejście); strunowy
opcjonalne mapowanie numerów etykiet

-o --out-file=(wyjście, wymagane); strunowy
nazwa pliku wyjściowego, do którego mają zostać zapisane odległości. Plik wyjściowy to plik csv,
zawierające odległości podane dla każdej etykiety.

Pomoc & Informacia
-V --verbose=ostrzeżenie
gadatliwość wyjścia, komunikaty drukowane na danym poziomie i wyższych priorytetach.
Obsługiwane priorytety zaczynające się od najniższego poziomu to:
Informacje ‐ Komunikaty niskiego poziomu
wyśledzić ‐ Śledzenie wywołań funkcji
nie ‐ Zgłoś niepowodzenia testu
ostrzeżenie ‐ Ostrzeżenia
błąd ‐ Zgłoś błędy
debug ‐ Wyjście debugowania
wiadomość ‐ Normalne wiadomości
fatalny ‐ Zgłoś tylko błędy krytyczne

--prawa autorskie
drukuj informacje o prawach autorskich

-h --pomoc
wydrukuj tę pomoc

-? --stosowanie
wydrukuj krótką pomoc

--wersja
wydrukuj numer wersji i wyjdź

Przetwarzanie
--wątki=-1
Maksymalna liczba wątków do wykorzystania do przetwarzania, ta liczba powinna być mniejsza
lub równa liczbie rdzeni procesora logicznego w maszynie. (-1:
automatyczne oszacowanie). Maksymalna liczba wątków do wykorzystania do przetwarzania, to
liczba powinna być mniejsza lub równa liczbie rdzeni procesora logicznego w
maszyna. (-1: estymacja automatyczna).

WTYCZKI: obraz 3d/io

w czasie rzeczywistym sprawiają, Przeanalizuj obraz 7.5

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .HDR, .hdr

Obsługiwane typy elementów:
bez znaku 8-bitowy, ze znakiem 16-bitowy, ze znakiem 32-bitowy, zmiennoprzecinkowy 32-bitowy,
zmiennoprzecinkowa 64-bitowa

pula danych Wirtualne IO do i z wewnętrznej puli danych

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .@

dicom Seria obrazów Dicom jako 3D

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .DCM, .dcm

Obsługiwane typy elementów:
16-bitowy ze znakiem, 16-bitowy bez znaku

hdf5 HDF5 3D obraz IO

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .H5, .h5

Obsługiwane typy elementów:
dane binarne, 8-bitowy ze znakiem, 8-bitowy bez znaku, 16-bitowy ze znakiem, 16-bitowy bez znaku,
32-bitowy ze znakiem, 32-bitowy bez znaku, 64-bitowy ze znakiem, 64-bitowy bez znaku, zmiennoprzecinkowy
punkt 32-bitowy, zmiennoprzecinkowy 64-bitowy

Inria INRIA obraz

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .INR, .inr

Obsługiwane typy elementów:
ze znakiem 8-bitowy, bez znaku 8-bitowy, ze znakiem 16-bitowy, bez znaku 16-bitowy, ze znakiem 32
bitowe, 32-bitowe bez znaku, zmiennoprzecinkowe 32-bitowe, zmiennoprzecinkowe 64-bitowe

mhd MetaIO 3D image IO z wykorzystaniem implementacji VTK (eksperymentalne).

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Obsługiwane typy elementów:
ze znakiem 8-bitowy, bez znaku 8-bitowy, ze znakiem 16-bitowy, bez znaku 16-bitowy, ze znakiem 32
bitowe, 32-bitowe bez znaku, zmiennoprzecinkowe 32-bitowe, zmiennoprzecinkowe 64-bitowe

nifti NIFTI-1 3D obraz IO

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .NII, .nii

Obsługiwane typy elementów:
ze znakiem 8-bitowy, bez znaku 8-bitowy, ze znakiem 16-bitowy, bez znaku 16-bitowy, ze znakiem 32
bitowe, 32-bitowe bez znaku, 64-bitowe ze znakiem, 64-bitowe bez znaku, zmiennoprzecinkowe 32
bit, zmiennoprzecinkowy 64 bit

wf Format rastrowy VFF Sun

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .VFF, .vff

Obsługiwane typy elementów:
bez znaku 8-bitowy, ze znakiem 16-bitowy

wzroku Widok 3D

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .V, .VISTA, .v, .vista

Obsługiwane typy elementów:
dane binarne, 8-bitowy ze znakiem, 8-bitowy bez znaku, 16-bitowy ze znakiem, 16-bitowy bez znaku,
32-bitowy ze znakiem, 32-bitowy bez znaku, zmiennoprzecinkowy 32-bitowy, zmiennoprzecinkowy 64
bit

wt Wejście i wyjście obrazu 3D VTK-XML (eksperymentalne).

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .VTI, .vti

Obsługiwane typy elementów:
ze znakiem 8-bitowy, bez znaku 8-bitowy, ze znakiem 16-bitowy, bez znaku 16-bitowy, ze znakiem 32
bitowe, 32-bitowe bez znaku, zmiennoprzecinkowe 32-bitowe, zmiennoprzecinkowe 64-bitowe

VTK Wprowadzanie i wyprowadzanie starszego obrazu 3D VTK (eksperymentalne).

Rozpoznawane rozszerzenia plików: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Obsługiwane typy elementów:
dane binarne, 8-bitowy ze znakiem, 8-bitowy bez znaku, 16-bitowy ze znakiem, 16-bitowy bez znaku,
32-bitowy ze znakiem, 32-bitowy bez znaku, zmiennoprzecinkowy 32-bitowy, zmiennoprzecinkowy 64
bit

PRZYKŁAD

Oceń odległości dla każdej etykiety dostępnej w image.v do odpowiednich etykiet w
image reference.v przechowuje wynik jako listę wartości oddzielonych przecinkami, tj
odległości.csv.

mia-3dodległość-stats -i obraz.v -r odniesienie.v -o odległości.csv

Autorski)

Gerta Wollnego

PRAWA AUTORSKIE

To oprogramowanie jest objęte prawami autorskimi (c) 1999‐2015 Lipsk, Niemcy i Madryt, Hiszpania. Nadchodzi
bez ABSOLUTNIE ŻADNEJ GWARANCJI i możesz ją redystrybuować zgodnie z warunkami GNU
OGÓLNA LICENCJA PUBLICZNA W wersji 3 (lub nowszej). Aby uzyskać więcej informacji, uruchom program za pomocą
opcja '--prawa autorskie'.

Korzystaj z mia-3ddistance-stats online, korzystając z usług onworks.net