Jest to polecenie nps2gps, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
nps2gps - konwertuje zestawy nukleotydów i białek na zestawy produktów genomowych ASN.1
STRESZCZENIE
nps2gps [-] [-D] [-F] [-G str] [-L] [-N] [-P] [-Q] [-R] [-T] [-U] [-f str] [-i filename]
[-o filename] [-p ścieżka] [-r ścieżka] [-x str]
OPIS
nps2gps konwertuje zestawy NCBI Bioseq z prostych zestawów nukleotydów i białek do pełnych zestawów genomowych
zestawy produktów wraz z transkryptami mRNA, które wyświetla jako tekst ASN.1.
OPCJE
Podsumowanie opcji znajduje się poniżej.
- Wydrukuj wiadomość o użyciu
-D Tytuły mRNA RefSeq
-F Mapa według identyfikatora funkcji
-G str Ogólna nazwa bazy danych ID
-L Wcześniej zablokuj komponenty
-N Promuj niekodujące RNA
-P Identyfikator mRNA z białka
-Q Specjalne tytuły mRNA
-R Włącz zdalne pobieranie z ID
-T Mapa według identyfikatora transkrypcji
-U Usuń niepotrzebne odniesienia do genów
-f str Filtr podciągów
-i filename
Pojedynczy plik wejściowy (domyślnie = stdin)
-o filename
Pojedynczy plik wyjściowy (domyślnie = stdout)
-p ścieżka
Ścieżka do plików do konwersji wsadowej
-r ścieżka
Ścieżka wyników konwersji wsadowej
-x str Sufiks wyboru pliku do konwersji wsadowej (domyślnie = ent)
Korzystaj z nps2gps online, korzystając z usług onworks.net