Jest to polecenie qlob.pl, które można uruchomić w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
qlob.pl - uruchom szybkie porównanie mursaki
STRESZCZENIE
qlob.pl [opcje] {lista genomów...}
qlob jest nakładką na murasaki (poprzez qsub, jeśli jest dostępny). To automatycznie
generuje dla Ciebie nazwę wyjściową na podstawie plików wejściowych, ustawia bardziej rozsądną pamięć
limit, uruchamia zadanie i generuje dane wyjściowe w postaci wykresu punktowego.
Oprócz standardowych opcji Murasaki (zobacz murasaki --help), qlob obsługuje niektóre
kilka własnych opcji:
Opcje:
-P używa starego wzorca 11111100100001111100000100101111
--cel= żąda uruchomienia zadania na nazwie hosta
-n|--name nazwa zadania (pozwala na nadpisanie starych wyników)
-m|--mem określa wymagania dotyczące pamięci do przekazania do qsub (domyślnie 4 GB)
--mpi=N używa MPI na N maszynach (ustawia również ppn=4)
--myrinet wymaga węzłów myrinet
--kogfile= Uruchom filter.pl, aby ocenić wyrównanie za pomocą
OPIS
To zdjęcie program uruchamia kilka sekwencji przez Murasaki. Po uruchomieniu na maszynie HPC
przesyła zadanie poprzez qsub.
Korzystaj z qlob.pl online korzystając z usług onworks.net
