Jest to polecenie tqs, które można uruchomić u dostawcy bezpłatnego hostingu OnWorks przy użyciu jednej z naszych wielu bezpłatnych stacji roboczych online, takich jak Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online systemu Windows lub emulator online systemu MAC OS
PROGRAM:
IMIĘ
tqs — Sekwencje jakości przycinania Solexa-Illumina
STRESZCZENIE
Sekwencja wysokiej jakości wykończenia Solexa-Illumina odczytuje przy użyciu progów zdefiniowanych przez użytkownika.
OPCJE
-h, --pomoc
pokaż tę wiadomość pomocy i wyjdź
-f PLIK SEKW., --sequence plik=PLIK SEKW
Plik sekwencji Illumina — format wyjściowy z analizatora genomu 1G (_seq.txt):
7 1 255 669
AACCCCCACTCCTACAACGCCATCATTCCCCTCGAC
-qPLIKQUALNY, --qual plik=PLIKQQUALNY
Plik prb zawierający wszystkie intensywności Illuminy wygenerowane przez 1G
Analizator genomu (_prb.txt)
-l MER, --length=MER
Długość odczytów sekwencji (tj. liczba cykli sekwencjonowania, domyślnie=36)
-t PRÓG, --threshold=PRÓG
Wartość progowa intensywności podstawowej (-40 do 40, domyślnie=5)
-d RÓŻNICA, --różnica=RÓŻNICA
Różnica w intensywności podstawowej pomiędzy intensywnością najwyższą a drugą najlepszą (1 do 80,
domyślnie=5)
-c KONSEK, --consec=KONSEK
Minimalna liczba kolejnych zasad przekraczających wartości progowe (domyślnie=20)
-v, --pełne
Działa w trybie pełnym.
Korzystaj z tqs online, korzystając z usług onworks.net
