wossinpute - Online w chmurze

PROGRAM:

IMIĘ

wossinput - Znajduje programy według danych wejściowych EDAM

STRESZCZENIE

wosinput -identyfikator ciąg [-eksplodować boolean] [-pokaż słowa kluczowe boolean] -wrażliwy boolean
-podklasy boolean -przestarzały boolean -wyryć boolean -ambasada boolean
- pokaż ambasadę ciąg -okrężnica boolean -gui boolean [-plik wyjściowy plik wyjściowy]
[-html przełącznik] [-grupy boolean] [-alfabetyczny boolean]

wosinput -Pomoc

OPIS

wosinput to program wiersza poleceń firmy EMBOSS („The European Molecular Biology Open
Pakiet oprogramowania"). Jest częścią grupy komend "Ontologia:EDAM,Dokumentacja".

OPCJE

Wkład Sekcja
-identyfikator ciąg

Dodatkowy Sekcja
-eksplodować boolean
Grupy, do których należą aplikacje EMBOSS, mają dwie formy, eksplodowane i nie
eksplodował. Rozbite nazwy grup są liczniejsze i często niejasno sformułowane niż
te niewybuchowe. Rozbite nazwy są tworzone z definicji grupy
nazwy, które zaczynają się jak NAZWA1:NAZWA2 i które są następnie rozwijane w wiele kombinacji
nazw jako: „NAZWA1”, „NAZWA2”, „NAZWA1 NAZWA2”, NAZWA2 NAZWA1”. Nierozszerzone nazwy
są po prostu takie: „NAZWA1 NAZWA2”. Wartość domyślna: N

-pokaż słowa kluczowe boolean
Wartość domyślna: N

Zaawansowany Sekcja
-wrażliwy boolean
Domyślnie słowa kluczowe zapytania są dopasowywane do nazw terminów EDAM (i synonimów)
tylko. Ta opcja dopasowuje również słowa kluczowe do definicji terminów EDAM i spowoduje:
dlatego (zwykle) zgłaszaj więcej dopasowań. Wartość domyślna: N

-podklasy boolean
Rozszerz dopasowania zapytań o wszystkie terminy będące specjalizacjami (EDAM
podklasy) dopasowanego typu. Wartość domyślna: Y

-przestarzały boolean
Domyślnym zachowaniem jest nieużywanie lub zwracanie przestarzałych terminów. Ta opcja, jeśli jest ustawiona, spowoduje
zawierać wszystkie terminy. Wartość domyślna: N

-wyryć boolean
Jeśli użyjesz tej opcji, przeszukana zostanie dokumentacja programu EMBOSS. Jeśli to
jest ustawiona na false, to przeszukiwane będą tylko programy EMBASSY (jeśli
-opcja ambasady jest prawdziwa). Programy EMBASSY nie są ściśle częścią programu EMBOSS, ale należy używać
te same biblioteki kodu i mają ten sam wygląd i działanie, ale są ogólnie opracowane
przez ludzi, którzy chcą, aby programy były poza schematem Powszechnej Licencji Publicznej GNU
Wartość domyślna: Y

-ambasada boolean
Jeśli użyjesz tej opcji, zostanie przeszukana dokumentacja programu EMBASSY. Jeśli to
jest ustawiona na false, to przeszukiwane będą tylko programy EMBOSS (jeśli
-wytłoczenie jest prawdziwe). Programy EMBASSY nie są ściśle częścią programu EMBOSS, ale korzystają z
te same biblioteki kodu i mają ten sam wygląd i działanie, ale generalnie są tworzone przez
ludzie, którzy chcą, aby programy były poza schematem Powszechnej Licencji Publicznej GNU
Wartość domyślna: Y

- pokaż ambasadę ciąg
Jeśli użyjesz tej opcji, ta dokumentacja programu pakietu EMBASSY będzie
wyszukiwane. Programy EMBASSY nie są ściśle częścią EMBOSS, ale używają tego samego kodu
biblioteki i mają ten sam wygląd i styl, ale są zazwyczaj tworzone przez ludzi, którzy:
chcesz, aby programy były poza schematem GNU General Public Licence

-okrężnica boolean
Grupy, do których aplikacje EMBOSS należą do maksymalnie dwóch poziomów, na przykład
grupa podstawowa „ALIGNMENT” ma kilka podgrup lub grup drugiego poziomu, np.:
ZGODNOŚĆ, RÓŻNICE, WYKRESY DOT, GLOBALNY, LOKALNY, WIELOKROTNY. Aby wspomóc programy, które analizują
wyjściem wossname, które wymagają nazw tych podgrup, będzie dwukropek ':'
umieszczana między pierwszym a drugim poziomem nazwy grupy, jeśli ta opcja jest prawdziwa.
Uwaga: nie dotyczy to sytuacji, w których nazwy grup zostały eksplodowane za pomocą „rozbicia”
opcja. Wartość domyślna: N

-gui boolean
Ta opcja ma pomóc tym, którzy projektują graficzne interfejsy użytkownika, aby:
aplikacje EMBOSS. Niektóre programy EMBOSS są nieodpowiednie do uruchamiania w GUI,
obejmują one inne programy menu i interaktywne edytory. Ta opcja umożliwia:
zgłaszaj tylko te programy, które można uruchomić z GUI Wartość domyślna: N

Wydajność Sekcja
-plik wyjściowy plik wyjściowy
Wartość domyślna: stdout

Html Sekcja
-html przełącznik
Jeśli wysyłasz dane wyjściowe do pliku, spowoduje to sformatowanie go w celu wyświetlenia jako tabeli
w dokumencie WWW. Wartość domyślna: N

-grupy boolean
Jeśli użyjesz tej opcji, tylko nazwy grup będą wyprowadzane do pliku Default
wartość: N

-alfabetyczny boolean
Jeśli użyjesz tej opcji, otrzymasz pojedynczą listę nazw programów i
opisy zamiast programów wymienionych w ich grupach funkcjonalnych. Domyślny
wartość: N

Korzystaj z wossinpute online za pomocą usług onworks.net