To jest aplikacja dla systemu Linux o nazwie 123VCF, której najnowszą wersję można pobrać jako 123VCF_binary.tar.gz. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online tę aplikację o nazwie 123VCF z OnWorks za darmo.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
123VCF
OPIS
123VCF został opracowany, aby etap filtracji plików VCF był bardziej niezawodny i wydajny.
Może być stosowany w najważniejszym etapie sekwencjonowania całego egzomu i analizy danych sekwencjonowania całego genomu w badaniach, a także w warunkach klinicznych.
Pobiera tylko plik kolejności filtrowania i plik wariantów, a następnie filtruje warianty na podstawie tego, co zamówiłeś w pliku kolejności filtracji.
Instrukcja obsługi:
https://dl.adbioinformatics.net/123VCF/123VCF_Manual.ver1.pdf
_____________________________________
Autorzy: Milad Eidi, Samaneh Abdolalizadeh, Soheila Moeini
Opiekunowie: dr Javad Zahiri - dr Masoud Garshasbi
Zakładka Charakterystyka
- Graficzny interfejs użytkownika
- Łatwy w użyciu
- Łatwy do zrozumienia
- Skompresowane lub nieskompresowane pliki VCF jako dane wejściowe
- Przetrwane warianty obecne w formacie VCF, format oddzielony tabulatorami
- 123VCF umieszcza te same warianty funkcji BED, gdy użytkownik definiuje filtr BED obok siebie w pliku TSV w celu wykrycia możliwych złożonych wariantów heterozygotycznych
Publiczność
Edukacja, zaawansowani użytkownicy końcowi, użytkownicy końcowi/komputery stacjonarne, testerzy
Interfejs użytkownika
Huśtawka Java
Język programowania
Java
Kategorie
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/project123vcf/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
