Jest to aplikacja dla systemu Linux o nazwie Allelome.PRO do działania w systemie Linux online, której najnowszą wersję można pobrać jako Allelome_PRO.zip. Można go uruchomić online w bezpłatnym dostawcy hostingu OnWorks dla stacji roboczych.
Pobierz i uruchom online aplikację o nazwie Allelome.PRO, która będzie działać bezpłatnie w systemie Linux online z OnWorks.
Postępuj zgodnie z tymi instrukcjami, aby uruchomić tę aplikację:
- 1. Pobrałem tę aplikację na swój komputer.
- 2. Wpisz w naszym menedżerze plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 3. Prześlij tę aplikację w takim menedżerze plików.
- 4. Uruchom emulator online OnWorks Linux lub Windows online lub emulator online MACOS z tej witryny.
- 5. W systemie operacyjnym OnWorks Linux, który właśnie uruchomiłeś, przejdź do naszego menedżera plików https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX z wybraną nazwą użytkownika.
- 6. Pobierz aplikację, zainstaluj ją i uruchom.
ZRZUTY EKRANU
Ad
Allelome.PRO do uruchomienia w systemie Linux online
OPIS
Wykrywanie błędów allelicznych z danych sekwencjonowania o dużej przepustowości wymaga podejścia, które maksymalizujeczułość przy jednoczesnej minimalizacji fałszywych trafień. Tutaj przedstawiamy Allelome.PRO, zautomatyzowane, przyjazne dla użytkownika narzędzie
potok bioinformatyczny, który wykorzystuje dane sekwencjonowania o dużej przepustowości z wzajemnych krzyżówek
dwóch genetycznie różnych szczepów myszy w celu wykrycia ekspresji specyficznej dla alleli i chromatyny
modyfikacje. Allelome.PRO rozszerza podejście stosowane w poprzednich badaniach, które obejmowały wyłącznie analizę
odciśnięte wyrażenie, aby dać pełny obraz „allelomu” poprzez automatyczną kategoryzację
alleliczna ekspresja wszystkich genów w danym typie komórek na imprinted, szczep biallelic lub noninformative.
Allelome.PRO oferuje zwiększoną czułość do wspólnej analizy transkryptów o niskiej ekspresji
z solidnym współczynnikiem fałszywych odkryć obliczonym empirycznie na podstawie zmienności danych sekwencjonowania.
Publiczność
Nauka/Badania
Interfejs użytkownika
Wiersz poleceń
Język programowania
Powłoka Unix, Perl, S/R
Jest to aplikacja, którą można również pobrać z https://sourceforge.net/projects/allelomepro/. Został umieszczony w OnWorks, aby można go było uruchomić online w najprostszy sposób z jednego z naszych bezpłatnych systemów operacyjnych.
